Keyword: cytochrome b

Molecular data suggest that Calomys boliviae (Thomas, 1901) would be a valid species belonging to the western lineage of the Calomys callosus complex (Rodentia, Cricetidae)

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The Calomys callosus complex involves species with medium to large body sizes for the genus and so far includes C. callosus sensu stricto, C. fecundus, C. callidus, C. venustus, C. tocantinsi, and Calomys sp., the latter representing populations from the Beni savannah of Bolivia. There is also a species named C. boliviae from the Yungas ecoregion of central Bolivia, which has often been synonymized with C. fecundus, a species found in the Tucumane-Bolivian Yungas ecoregion of northern Argentina and southern Bolivia. In the present study, we report the molecular analysis, based on the mitochondrial Cyt-b gene, of specimens of Calomys sampled in the Bolivian Yungas in an area close to the type locality of C. boliviae. Phylogenetic results showed that the sequences of the specimens studied formed a clade distinct from C. fecundus and that, taking into account its geographical closeness to the typical area of C. boliviae, they could be representing this nominal form. If this hypothesis is true, C. boliviae should be resurrected as a valid species of Calomys belonging to the western lineage within the C. callosus complex.

Los datos moleculares sugieren que Calomys boliviae (Thomas, 1901) sería una especie válida perteneciente al linaje occidental del complejo Calomys callosus (Rodentia, Cricetidae). El complejo Calomys callosus comprende especies con tamaños corporales medianos a grandes para el género, y hasta ahora incluye a C. callosus sensu stricto, C. fecundus, C. callidus, C. venustus, C. tocantinsi y Calomys sp.; esta última corresponde a poblaciones de la sabana del Beni de Bolivia. También hay una especie denominada C. boliviae de la ecorregión Yungas del centro de Bolivia que, a menudo, ha sido sinonimizada con C. fecundus, una especie que se encuentra en la ecorregión de las Yungas tucumano-bolivianas del norte de Argentina y el sur de Bolivia. En el presente estudio informamos el análisis molecular, basado en el gen mitocondrial Cyt-b, de especímenes de Calomys muestreados en las Yungas bolivianas en un área cercana a la localidad tipo de C. boliviae. Los resultados filogenéticos mostraron que las secuencias de los especímenes estudiados formaron un clado distinto de C. fecundus y que, teniendo en cuenta la cercanía geográfica del área típica de C. boliviae, podrían estar representando a esta forma nominal. Si esta hipótesis resulta ser cierta, C. boliviae debería ser resucitada como una especie válida de Calomys, perteneciente al linaje occidental dentro del complejo C. callosus.

Graphical abstract for the article “Molecular data suggest that Calomys boliviae (Thomas, 1901) would be a valid species belonging to the western lineage of the Calomys callosus complex (Rodentia, Cricetidae)” (M.L. Martin et al., 2025)

Síndrome pulmonar por hantavirus asociado al Orthohantavirus Alto Paraguay en Argentina. Estudio del caso humano y potencial roedor reservorio

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El síndrome pulmonar por hantavirus (SPH) es una enfermedad viral aguda causada por miembros del género Orthohantavirus, familia Hantaviridae. En Argentina, se evidenció la circulación de diversos genotipos patógenos en diferentes roedores reservorios. Asimismo, se han identificado al menos cuatro genotipos no patógenos para humanos. En 2020 se confirmó el diagnóstico de un paciente con SPH, residente en la localidad de Colonia Montefiore (provincia de Santa Fe), sin antecedentes de viaje. El genotipo de orthohantavirus detectado en este paciente fue Alto Paraguay. Este genotipo había sido detectado anteriormente solo en Paraguay en roedores identificados como Holochilus chacarius, pero no en pacientes con SPH. Dado que en Argentina no existían registros sobre la circulación de este genotipo, se realizaron muestreos de la comunidad de roedores en los potenciales sitios de contagio del caso humano. Se capturaron 59 roedores, de los cuales se detectó un individuo de H. chacarius infectado con el genotipo Alto Paraguay. La comparación de las secuencias nucleotídicas de un fragmento de los segmentos genómicos S y M correspondientes al caso humano de SPH y al roedor H. chacarius presentaron un 100% de identidad. Estos resultados confirman la circulación de un nuevo genotipo de orthohantavirus patógeno en Argentina, y aportan evidencias de su potencial asociación con roedores de la especie H. chacarius, información de importancia para la toma de medidas de prevención.

Hantavirus pulmonary syndrome associated with the Orthohantavirus Alto Paraguay in Argentina. Human case study and potential rodent reservoir. Hantavirus pulmonary syndrome (HPS) is an acute viral illness caused by members of the genus Orthohantavirus, family Hantaviridae. In Argentina, there is evidence of the circulation of several pathogenic genotypes in diferent rodent reservoirs. In addition, at least four non-pathogenic genotypes for humans have been identified. In 2020, a patient inhabiting Colonia Montefiore (province of Santa Fe) without any travel history was diagnosed with HPS. The orthohantavirus genotype detected in the patient was Alto Paraguay. This genotype had previously been detected only in Paraguay in rodents identified as Holochilus chacarius, but not in patients with HPS. Since the circulation of this genotype was unknown in Argentina, we studied the rodent communities in rural areas near the site of the human infection case. Fifty-nine rodents were captured, and one specimen of H. chacarius proved to be infected with the Alto Paraguay genotype. The viral sequences of the rodent were compared with those of the patient, finding 100% nucleotide identity for the fragments of the S and M genomic segments. These results confirm the circulation of a new pathogenic genotype of orthohantavirus in Argentina, and provide evidence of its potential association with rodents of the species H. chacarius, important information for prevention measures.

Graphical abstract for the article “Síndrome pulmonar por hantavirus asociado al Orthohantavirus Alto Paraguay en Argentina. Estudio del caso humano y potencial roedor reservorio” (Martin et al., 2024)

Mitochondrial genetic differentiation and phylogenetic relationships of three Eptesicus (Histiotus) species in a contact zone in Patagonia

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Eptesicus (Histiotus) magellanicus is a relatively rare and poorly known Patagonian endemic. This species is currently recognized as a valid, but until recently some authors treated it as a subspecies of E. (H.) montanus. In fact, no molecular data exist to support the distinctiveness of the former. In Patagonia, the distribution of these two species overlap marginally; they are also sympatric with a third Histiotus species, E. (H.) macrotus. In this study, we present for the first time molecular data that corroborate morphological evidence of the separation between E. (H.) magellanicus from other Eptesicus (Histiotus) species, in special the ones with which it shares its distribution. We sequenced a nuclear intron (THY) and the cytochrome b (Cyt b) gene from specimens of E. (H.) magellanicus, E. (H.) montanus, and E. (H.) macrotus, collected in the Chubut Province (Argentina), and from an undescribed Eptesicus (Histiotus) species from Peru. We included these sequences in a phylogenetic analysis together with previously published sequences of four typical Eptesicus species. The THY intron showed very little variation, while the Cyt b phylogeny recovered three highly supported Histiotus clades. A highly supported clade comprising all specimens of E. (H.) magellanicus was the first to split off Histiotus, suggesting that the Andean region was important during the early diversification of the genus. Unexpectedly, the clade containing the specimens of E. (H.) macrotus and E. (H.) montanus showed no internal resolution, either questioning their mutual identity as a separate species, or suggesting the occurrence of local hybridization and introgression.

Diferenciación genética mitocondrial y relaciones filogenéticas entre tres especies de Eptesicus (Histiotus) en una zona de contacto en la Patagonia. Eptesicus (Histiotus) magellanicus es una especie endémica de Patagonia, relativamente rara y pobremente conocida. Actualmente Eptesicus (Histiotus) magellanicus es reconocida como especie válida; sin embargo, recientemente ha sido considerada como subespecie de Eptesicus (H.) montanus por algunos autores. En Patagonia estas dos especies solapan sus distribuciones marginalmente, donde además son simpátricas con una tercera especie, Eptesicus (H.) macrotus. En este estudio presentamos por primera vez datos moleculares que corroboran la evidencia morfológica que diferencian a E. (H.) magellanicus del resto de las especies de Histiotus, en especial con aquellas con las que comparte su distribución. Se secuenciaron un intron del gen de la tirotropina y gen citocromo b para especímenes de E. (H.) magellanicus, E. (H.) montanus, y E. (H.) macrotus, colectados en la provincia del Chubut (Argentina), y dos ejemplares de Eptesicus (H.) sp. de Perú. Analizamos sus secuencias junto con otras previamente publicadas para cuatro especies típicas de Eptesicus. El gen tirotropina mostró muy poca variación, mientras que la filogenia obtenida con el gen citocromo b recuperó tres clados de Histiotus fuertemente soportados. El clado que incluyó a todos los especímenes de E. (H.) magellanicus fue el primero en separarse dentro de Histiotus, sugiriendo que la región andina fue importante durante la diversificación temprana del género. Inesperadamente, el clado que contenía las muestras de E. (H.) macrotus y de E. (H.) montanus no mostró resolución interna, sugiriendo dos posibles alternativas, la existencia de una única especie o la ocurrencia de hibridación e introgresión local.

Lestodelphys halli: new information on a poorly known Argentine marsupial

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Lestodelphys halli is a small, terrestrial didelphid marsupial known only from a few widely scattered, semidesert localities from Mendoza south to Santa Cruz in Argentina. We have updated the distribution map based on 17 traditional specimens and 31 catalogued and more than 15 uncatalogued individuals and lots of osteological remains recovered from owl pellets. Images taken from a videotape of a captive L. halli document the killing and partial consumption of a mouse, strongly supporting Thomas’ (1921) hypothesis that the species is predaceous. The karyotype consists of 14 chromosomes and is generally similar to that of other 2N = 14 marsupials. Study of a 281-base pair region of the cytochrome b gene compared to the same region in other South American didelphids suggests that Lestodelphys is most closely related to Thylamys, another small South American didelphid that occurs in southern Argentina, but does not elucidate the relationship of this clade to other genera previously hypothesized to be closely related to Lestodelphys.

Lestodelphys halli: nueva información sobre un marsupial argentino muy poco conocido. Lestodelphys halli es un marsupial didélfido de pequeño tamaño conocido solo por unas pocas y dispersas localidades en semidesiertos de Argentina, desde Mendoza hasta Santa Cruz. Nosotros hemos actualizado el mapa de distribución de la especie sobre la base de los 17 especímenes regulares y sobre evidencias adicionales obtenidas de 31 especímenes y lotes catalogados y al menos 15 especímenes obtenidos ambos de regurgitados de lechuzas. Una serie de fotografías obtenidas de una videofilmación de un Lestodelphys halli en cautiverio documenta la muerte y consumo parcial de un ratón, apoyando la sugerencia de Thomas (1921) sobre los hábitos de predador de esta especie. El cariotipo es de 14 cromosomas y es similar al 2N = 14 de otros marsupiales. Estudios utilizando regiones del ADN mitocondrial de esta especie, comparados con las mismas regiones del ADN mitocondrial de otros didélfidos sudamericanos, sugieren que Lestodelphys es la especie más cercanamente relacionada a Thylamys, otro pequeño didélfido que habita el sur de Argentina. Las relaciones filogenéticas de este ciado con otros géneros, previamente hipotetizados como cercanamente emparentados, permanecen sin resolver en nuestro estudio.