Present and prospects of research on Neotropical mammals using genomic approaches

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The recent revolution in sequencing methods allowed the generation of genomic, transcriptomic, and other large-scale data at a speed and low cost undreamed fifteen years ago. These large datasets can be used for understanding complex processes and are already a reality for many taxonomic groups in the world. The transition of several biological fields such as ecology, systematics, developmental biology and biological conservation into the genomic era promises to foster our understanding of functional and structural mammalian biodiversity in Neotropics, as new sequencing technologies liberate virtually any species from genomic ignorance and transform them into new study models. Here, we aim to first give a brief overview on recent development of genomic technologies and then illustrate how these technologies are being used to study Neotropical mammals in several fields. Finally, we discuss caveats and future perspectives, as the number of genomic sequences available is continually increasing and opening new avenues for research. Although progressing in a slower pace when compared to other mammals of the world, genomics has already provided important insights and promises to deliver many more. Considering the great importance of Neotropical realm and all the threats that biodiversity must face on this biogeographical area, the future of the diversity of mammals here depends largely on urgent conservation actions based on scientific knowledge, making genomics as useful as never before.


Presente y futuro de la investigación en mamíferos neotropicales usando abordajes genómicos. La reciente revolución en métodos de secuenciación ha hecho posible la generación de datos genómicos, trans-criptómicos y otros a gran escala a un costo más bajo y gran velocidad, algo impensable hace quince años. Esos datos ya son una realidad para muchos grupos taxonómicos y pueden ser usados para entender procesos complejos. La transición de muchas áreas de la biología como ecología, sistemáticas, biología del desarrollo y biología de la conservación hacia la era genómica deberá promover la comprensión de la biodiversidad fun-cional y estructural en la región Neotropical, así como retirar virtualmente cualquier especie de la ignorancia genómica y transformarlas en nuevos modelos de estudio. En ese trabajo, tuvimos por objetivo brindar una breve descripción del desarrollo reciente de tecnologías genómicas para después ilustrar cómo esas tecnologías están siendo usadas para estudiar los mamíferos neotropicales en diversas áreas de conocimiento. Finalmente discutiremos algunas limitaciones y perspectivas futuras una vez que el número de secuencias disponibles es cada vez mayor y abre nuevos caminos para investigación. Aunque progresando a un paso más lento que otros mamíferos del mundo, la genómica ya ha generado muchas informaciones importantes y promete aún más. Considerando la gran importancia del reino Neotropical y todas las amenazas que la biodiversidad enfrenta en esa región biogeográfica, el futuro de la diversidad de sus mamíferos depende en gran parte de medidas urgentes de conservación basadas en conocimiento científico, lo que hace con que la genómica sea importante como nunca antes.


Perspectivas da pesquisa en mamíferos neotropicais usando abordagens genómicas. A recente revolução nos métodos de sequenciamento vem permitindo a geração de dados moleculares em larga escala em velocidades e custo-benefício nunca sonhados 15 anos atrás. Esses bancos de dados massivos podem ser usados para compreender processos biológicos complexos, sendo empregados atualmente para inúmeros grupos taxonômicos. A transição de diversas áreas da Ciência como Ecologia, Sistemática, Biologia do Desenvolvimento e Biologia da Conservação para a Era Genômica carrega a promessa de alavancar nossa compreensão acerca da biodiversidade funcional e estrutural de mamíferos neotropicais, a medida que as novas tecnologias de seqüen-ciamento transformam praticamente qualquer espécie em um novo modelo de estudo. Nessa revisão, fornecemos uma visão geral sobre o desenvolvimento recente de tecnologias genômicas. Em seguida, ilustramos como essas tecnologias estão sendo usadas para estudar mamíferos neotropicais em diferentes campos de estudo. Por fim, discutimos advertências e perspectivas futuras, com o aumento da disponibilidade de seqüências genômicas abrindo novos caminhos para a pesquisa científica. Embora progredindo em um ritmo mais lento quando com-parado a outros mamíferos do mundo, o estudo genômico de mamíferos neotropicais têm fornecido informações essenciais sobre nossa fauna endêmica e promete entregar muito mais nos próximos anos. Considerando a grande importância do reino neotropical e os diferentes tipos de ameaças à biodiversidade dessa área biogeográfica, o futuro da diversidade de mamíferos neotropicais depende, em grande parte, de ações de conservação urgentes baseadas no conhecimento científico, tornando os métodos genômicos mais úteis do que nunca.