Autor: José M. Barbanti Duarte

José M.B. Duarte, J. Maurício B. Duarte, José Mauricio Barbanti Duarte

Speciation, evolutionary history and conservation trends of Neotropical deer

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Neotropical deer species have broad geographic ranges in vulnerable Latin American ecosystems. Habitat destruction and overhunting have limited deer species to a portion of their historical ranges. Our aims are to provide an overview of the current state of knowledge of Neotropical deer species systematics and evolutionary history, and to discuss their current conservation status. Genetic methods lead to a reassessment of earlier systematics, largely based only on morphological analyses, and revealed several cryptic species. Neotropical deer species show substantial karyotypic variation from 2n = 32 to 2n = 70. Moreover, several species with chromosomal polymorphisms and complex karyotypes have been described in the genus Mazama. Analysis of the complete cytochrome b gene revealed two clades with different evolutionary histories. Mazama and Hippocamelus are not monophyletic genera, and both genera include cryptic species. At least two new red brocket deer species need to be described and their geographic range and population status assessed. Based on the latest IUCN Red List of Threatened Species™, 59% of the 17 Neotropical deer species are threatened and 12% are listed as Data Deficient (DD). The contribution of genetic and biogeographic data will be useful for solving taxonomic uncertainties and updating the assessment of the conservation status of species in Latin American ecosystems, providing data to perform models for testing management and conservation policies.

Los ciervos neotropicales: patrones de especiación, su historia evolutiva y el estado de conservación. Las especies de ciervos neotropicales tienen amplios rangos de distribución geográfica en los ecosistemas vulnerables de América Latina. La destrucción del hábitat y la caza excesiva han limitado las especies a una parte de sus rangos históricos. Nuestros objetivos son proporcionar una visión global del estado actual del conocimiento de la sistemática de las especies de ciervos neotropicales así como de su historia evolutiva, y discutir su estado de conservación actual. El empleo de métodos genéticos permitió una reevaluación de la sistemática anterior, basada en gran parte solo en análisis morfológicos, y reveló la existencia de varias especies crípticas. Las especies de ciervos neotropicales muestran una variación cariotípica sustancial de 2n = 32 a 2n = 70. Además, varias especies con polimorfismos cromosómicos y cariotipos complejos se han descrito en el género Mazama. El análisis del gen completo del citocromo b reveló dos clados con diferentes historias evolutivas. Mazama e Hippocamelus no son géneros monofiléticos, incluyendo especies crípticas. Se deben describir al menos dos nuevas especies de corzuelas rojas y se debe evaluar su rango geográfico y estado poblacional. Según la última Lista Roja de Especies Amenazadas de la UICN™, el 59% de las 17 especies de ciervos neotropicales están amenazadas y el 12% figuran como deficientes en datos (DD). La contribución de los datos genéticos y biogeográficos será útil para resolver las incertidumbres taxonómicas y actualizar la evaluación del estado de conservación de las especies en los ecosistemas de América Latina, proporcionando datos para realizar modelos para evaluar las políticas de gestión y conservación.

Cervídeos neotropicais: padrões de especiação, sua história evolutiva e estado de conservação. As espécies de cervídeos neotropicais tem ampla distribuição geográfica em ecossistemas vulneráveis da América Latina. A destruição do habitat e a caça excessiva limitaram as espécies de cervídeos a uma parte de suas distribuições históricas. Objetivamos aqui fornecer uma visão geral do estado atual do conhecimento da sistemática e da história evolutiva das espécies de cervídeos neotropicais e discutir seu status atual de conservação. Métodos genéticos levaram a uma reavaliação da sistemática anterior, baseada apenas em análises morfológicas, e revelaram várias espécies crípticas. As espécies de cervídeos neotropicais apresentam variação cariotípica substancial, de 2n = 32 a 2n = 70. Além disso, várias espécies com polimorfismos cromossômicos e cariótipos complexos foram descritas no gênero Mazama. A análise do gene completo do citocromo b revelou dois clados com diferentes histórias evolutivas. Mazama e Hippocamelus não são gêneros monofiléticos, e ambos incluem espécies crípticas. Pelo menos duas novas espécies de veados vermelhos precisam ser descritas e sua distribuição geográfica e status populacional avaliados. Com base na última Lista Vermelha de Espécies Ameaçadas da IUCN™, 59% das 17 espécies de cervídeos neotropicais estão ameaçadas e 12% estão listadas como Dados Deficientes (DD). A contribuição de dados genéticos e biogeográficos será útil para solucionar incertezas taxonômicas e atualizar a avaliação do estado de conservação de espécies em ecossistemas latino-americanos, fornecendo dados para realizar modelos de teste de gestão e políticas de conservação.

A cost-effective method for rapid identification of the southern muriqui (Brachyteles arachnoides): a contribution for the control of illegal bushmeat trade

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To control illegal wildlife-product trade and protect endangered species of animals, unambiguous identification of the captured specimens is essential. Forensic genetic tools have contributed to identify animal species for conservation purposes promoting accurate results for informing public policies and management of the biodiversity. The southern muriqui (Brachyteles arachnoides) is the largest non-human primate of the Neotropical region and is critically endangered (IUCN Red List of Threatened Species), mainly due to the illegal hunting for bushmeat. In this study, we describe a molecular method using PCR/RFLP to differentiate between bushmeat of southern muriqui and the meat of the domestic animals most commonly consumed in Brazil (Bos taurus, Ovis aries, Capra hircus, and Sus scrofa). The method is based on the amplification and digestion with BanI restriction enzyme of the 16S mtDNA region. We also examine 16S mtDNA sequences of the southern muriqui and other 13 sympatric and parapatric wild species of mammals also hunted for bushmeat to examine whether homologies of the BanI restriction sites could lead to species misidentification. The results indicate the utility of this tool as it represents a simple and cost-effective method to differentiate southern muriqui samples from those of the examined domestic and wild sympatric and parapatric species. We hope this molecular tool will help public authorities in crime prevention, and enhance law reinforcement of illegal hunting of threatened animal species.

Um método rápido e simples para a identificação do muriqui-do-sul (Brachyteles arachnoides): uma contribuição para o combate à caça ilegal. Para controlar o comércio ilegal de vida selvagem e proteger espécies animais ameaçadas, é essencial a identificação inequívoca dos espécimes capturados. Ferramentas de genética forense têm contribuído na identificação de animais para fins conservacionistas, fornecendo resultados precisos utilizados em políticas de gestão da biodiversidade. O muriqui-do-sul (Brachyteles arachnoides) é o maior primata não humano da região neotropical e está criticamente em perigo (Lista Vermelha da IUCN) devido, principalmente, à caça ilegal para consumo de sua carne. Nesse estudo, descrevemos um método molecular baseado em PCR/RFLP para diferenciar a carne do muriqui-do-sul da carne dos animais domésticos mais consumidos no Brasil (Bos taurus, Ovis aries, Capra hircus, and Sus scrofa). Este método é baseado na amplificação e digestão da região 16S mtDNA com a enzima de restrição BanI. Além disso, sequências da região do 16S mtDNA do muriqui-do-sul e de 13 espécies de mamíferos simpátricos e parapátricos também caçados por sua carne foram examinadas para avaliar a presença de sítios de restrição homólogos que pudessem comprometer a identificação do muriqui-do-sul. Os resultados indicam a utilidade desta ferramenta por representar um método simples e de baixo custo que permite diferenciar amostras de muriqui-do-sul das amostras das espécies domésticas e selvagens que foram examinadas. Esperamos que esta ferramenta molecular ajude as autoridades na prevenção de crimes contra a biodiversidade e cumprimento da legislação contra a caça ilegal de animais ameaçados.

Estudo populacional de gambás, Didelphis albiventris (Mammalia, Didelphidae), em um pequeno fragmento florestal

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Os gambás são animais generalistas em termos ecológicos, tendo, em geral, abundância aumentada em fragmentados florestais. Sendo assim, eles são importantes indicadores para o entendimento da dinâmica desses fragmentos. Foi estudada, ao longo de 1 ano, uma população de gambás (Didelphis albiventris) em um fragmento de floresta estacional semidecidual de 7 ha e seu entorno agrícola. Estimaram-se, mensalmente, a abundância populacional, a composição etária e a proporção sexual. Foi possível constatar dois movimentos dos indivíduos entre as áreas estudadas (fragmento e entorno). A flutuação populacional apresentou um padrão anual com um pico populacional na estação seca.

Population study of white-eared-opossum, Didelphis albiventris (Mammalia, Didelphidae), in a small forest fragment. The white-eared-opossums are habitat generalist animals and occur in high abundance in forest fragments. Therefore these animals are important to understand the dynamics of this landscape. The population of Didelphis albiventris in a 7 ha stational semidecidual forest fragment and its agricultural surroundings was studied during one year. The population abundance, age structure and sex ratio were estimated monthly. Two movements between the fragment and the surrounding area were detected. The population dynamics showed an annual pattern with a high peak during the dry season.

Discovery of the first wild population of the small red brocket deer Mazama bororo (Artiodactyla: Cervidae)

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Mazama bororo was described from a few captive specimens in Brazil by cytogenetic and morphological characters. These specimens supposedly originated in the Southern Atlantic Forest; however, no wild population has been reported. This study was initiated in 1998 to investigate the presence of this species in forest remnants of the Paranapiacaba mountain range, south São Paulo State, Brazil. Five specimens were captured between 2000 and 2002. Cytogenetic analysis from blood samples confirmed its specific identification, documenting the first population of small red brocket deer at the Intervales State Park.

Descubrimiento de la primera población silvestre de la pequeña corzuela roja Mazama bororo (Artiodactyla: Cervidae). Mazama bororo fue descrita a partir de algunos ejemplares cautivos en Brasil, a través de caracteres citogenéticos y morfológicos. El origen estimado de estos animales indicaba la presencia de la especie al sur del Bosque Atlántico, pero no se había reportado hasta la actualidad ninguna población en estado silvestre. Este estudio se inició en 1998 con el objetivo de investigar la presencia de la especie en remanentes de bosque en la Sierra del Paranapiacaba, al sur del estado de São Paulo, Brasil. Fueron capturados cinco especímenes entre 2000 y 2002. Los análisis citogenéticos de muestras sanguíneas confirmaron la identidad específica, reportándose la primera población de corzuela roja pequeña en el Parque Estatal Intervales.

Área de uso e utilização de habitat de cachorro-do-mato (Cerdocyon thous Linnaeus, 1766) no cerrado da região central do Tocantins, Brasil

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Cerdocyon thous é um canídeo com ampla distribuição geográfica pelo Brasil ocupando desde área abertas até ambientes florestados e na região central do Tocantins (Brasil) é um animal relativamente abundante. Entretanto, são poucos os dados na literatura que relatam o uso de habitat e a área de uso deste canídeo no bioma Cerrado. Desse modo,
o objetivo deste estudo foi avaliar o uso de habitat e a área de uso do C. thous no Cerrado na região central do Tocantins. Após a captura e o monitoramento dos animais por rádiotelemetria pode se observar que os animais utilizaram com maior freqüência o Cerrado latu sensu e strictu sensu. As áreas de uso variaram de 2.50 a 6.72 km2 para o MCP (Mínimo Polígono Convexo) e de 5.33 a 7.23 km2 para MH 95% (Média Harmônica 95%). A área centro (área de maior concentração de localizações MH 75%) ocupou 44% da área de uso calculada para a MH 95%. Assim o presente estudo vem contribuir com importantes informações sobre a ecologia deste canídeo em um dos biomas mais ameaçados do mundo.

Home range and habitat use of crab-eating fox (Cerdocyon thous Linnaeus, 1766), in the Cerrado of the central region of Tocantins, Brazil. Cerdocyon thous is a species widely distributed in Brazil, in a variety of habitats ranging from open area to forests and in the central region of Tocantins (Brazil) is relatively abundant. Nevertheless, literature related to habitat use and home range of this canid in the Cerrado biome is scarce. Therefore, the aim of this study was to evaluate the use of habitat and home range of this species in the Cerrado of the central region of Tocantins. After capturing and monitoring three animals by radiotracking, we concluded that all animals spent most of their time in cerrado latu sensu and strictu sensu. Their home range varied from 2.50 to 6.72 for the MCP (Minimum Convex Polygon) and from 5.33 to 7.23 for HM (95% Harmonic Mean). The core area (area with greatest concentration of localization 75% HM) was 44% of the home range calculated for 95% HM. Thus, the present study contributes to the ecology of this canid with valuable information in one of the most threatened biomes in the world.