Keyword: Atlantic Forest

Non-human primates collected during and after a yellow fever outbreak in eastern Brazil: demographic data, osteological implications, and viral prevalence

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Between 2016 and 2019, a sylvatic yellow fever (YF) outbreak affected Southeast Brazil, prompting a large-scale response to monitor non-human primates (NHP) as sentinels of viral circulation. Here we provide detailed data on NHP specimens collected between 2018 and 2021, presenting sex and estimated age, as well as information on osteological changes and trauma, and YF prevalence in NHP in Rio de Janeiro State, Southeastern Brazil. A total of 716 NHP from six taxa were documented across 48 municipalities: Callithrix sp. (N = 672), Callithrix aurita (N = 3), Sapajus nigritus (N = 28), Alouatta guariba (N = 7), Callicebus nigrifrons (N = 2), Leontopithecus rosalia (N = 3), and Leontopithecus chrysomelas (N = 1). Of these, only 19 tested positive for YF virus, predominantly Callithrix sp. (N = 14), followed by Alouatta guariba (N = 2), Callicebus nigrifrons (N = 2), and Leontopithecus rosalia (N = 1). Most Callithrix sp. specimens—hybrids of C. jacchus and C. penicillata—originated from urban centers, particularly Rio de Janeiro and Niterói. Notably, trauma-related injuries were recorded in 160 Callithrix sp., peaking during the outbreak, likely due to human aggression driven by misconceptions about YF transmission and/or roadkill events. Additionally, among 127 Callithrix sp. and three C. aurita specimens processed as skins and skeletons, 90 revealed pathological-like changes in teeth, skull, and appendicular skeleton, including porosity, translucency, bone remodeling, darkened spots, and fractures. While not directly linked to YF infection, these findings contribute to a broader understanding of NHP pathology and population health. This study represents one of the largest and most systematically curated collections of NHP from an epizootic event, providing an invaluable resource for disease ecology and conservation research. Our results emphasize the importance of long-term specimen preservation for monitoring emerging infectious diseases and assessing anthropogenic impacts on wildlife populations.

Entre 2016 e 2019, um surto de febre amarela silvestre (FA) afetou o Sudeste do Brasil, desencadeando uma resposta em larga escala para monitorar primatas não humanos (PNH) como sentinelas da circulação viral. No presente estudo apresentamos dados detalhados sobre espécimes de PNH coletados no estado do Rio de Janeiro entre 2018 e 2021, incluindo informações sobre sexo, idade estimada, alterações osteológicas, traumas e a prevalência de FA de amostra. No total, foram documentados 716 PNH pertencentes a seis táxons em 48 municípios: Callithrix sp. (N = 672), Callithrix aurita (N = 3), Sapajus nigritus (N = 28), Alouatta guariba (N = 7), Callicebus nigrifrons (N = 2), Leontopithecus rosalia (N = 3) e Leontopithecus chrysomelas (N = 1). Desses, apenas 19 testaram positivo para o vírus da FA, predominantemente Callithrix sp. (N = 14), seguido por Alouatta guariba (N = 2), Callicebus nigrifrons (N = 2) e Leontopithecus rosalia (N = 1). A maioria dos espécimes de Callithrix sp. —híbridos entre C. jacchus e C. penicillata— originou-se de centros urbanos, especialmente Rio de Janeiro e Niterói. Lesões associadas a traumas foram registradas em 160 indivíduos de Callithrix sp., com um pico durante o surto, possivelmente devido à agressão humana motivada por concepções equivocadas sobre a transmissão da FA e/ou atropelamentos. Além disso, entre 127 espécimes de Callithrix sp. e três C. aurita processados como peles e esqueletos, 90 apresentaram alterações sugestivas de patologias nos dentes, crânio e esqueleto apendicular, incluindo porosidade, transparência, remodelação óssea, manchas escurecidas e fraturas. Embora não estejam diretamente relacionados à infecção por FA, esses achados contribuem para uma compreensão mais ampla sobre a saúde populacional dos PNH. A amostra aqui avaliada representa uma das maiores e mais sistematicamente organizadas coleções de PNH provenientes de um evento epizoótico, constituindo um recurso valioso para pesquisas em ecologia, epidemiologia e conservação. Nossos resultados destacam a importância da preservação a longo prazo de espécimes para o monitoramento de doenças emergentes e a avaliação dos impactos antropogênicos sobre as populações de PNH de vida livre.

Graphical abstract for the article “Non-human primates collected during and after a yellow fever outbreak in eastern Brazil: demographic data, osteological implications, and viral prevalence” (Cezar et al., 2025)

Medium and large mammals of Caparaó National Park, southeastern Brazil

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Brazil is considered one of the countries with the highest diversity of mammals in the world. However, there are still many gaps in the knowledge of the ecology of mammalian species and because they are threatened by anthropic activities, it becomes increasingly necessary to gather information that contributes to their conservation. We characterized the medium and large-sized mammals in the Caparaó National Park (CNP), by analyzing species richness and frequency of records (hereafter abundance) in the two main vegetation types (i.e., Ombrophilous Forest and High Elevation Grasslands) found in the park. We carried out active searches and installed camera traps associated with sand-plots in 30 sampling sites. We performed rarefaction curves to verify that the sampling effort was suffcient to characterize species richness of the CNP, and we ordered the data obtained for species composition and abundance using a Non-Metric Multidimensional Scaling, and assessed the relationship between the season (dry and rainy seasons) and vegetation types on mammalian species richness with a two-way analysis of variance. We recorded 34 native species of medium and large mammals, and one exotic species (Canis lupus familiaris). Species composition and abundance differed between vegetation types. The Ombrophilous Forest presented higher species richness than the High Elevation Grasslands, which demonstrates that the medium and large mammalian community may be influenced by the environmental complexity. The CNP holds a rich community of medium and large mammals, with many endemic and endangered species of the Atlantic Forest.

Mamíferos de médio e grande porte no Parque Nacional do Caparaó: composição, riqueza e abundância. O Brasil é considerado um dos países com maior diversidade de mamíferos do mundo. No entanto, ainda existem muitas lacunas no conhecimento da ecologia das espécies de mamíferos e, por estarem ameaçadas por atividades antrópicas, torna-se cada vez mais necessário reunir informações que contribuam para sua conservação. O objetivo desse estudo foi caracterizar a comunidade de mamíferos de médio e grande porte do Parque Nacional do Caparaó (PNC) analisando riqueza e abundância em duas principais fitofisionomias (i.e., Floresta Ombrófila e Campos de Altitude). Nossa hipótese foi de que a heterogeneidade ambiental exerce influência na comunidade de mamíferos. Instalamos 30 armadilhas fotográficas associadas a parcelas de areia nas duas principais fitofisionomias. Produzimos uma curva de rarefação para verificar se o esforço amostral foi suficiente para caracterizar a comunidade. Os dados obtidos de composição e abundância foram ordenados pelo Escalonamento Multidimensional Não Métrico (NMDS) e avaliamos a relação entre a estação (estações seca e chuvosa) e tipos de vegetação na riqueza de espécies de mamíferos com uma análise de variância bidirecional (ANOVA de duas vias). Registramos 34 espécies de mamíferos de médio e grande porte nativos e uma espécie exótica (Canis lupus familiaris). A composição e abundância das espécies diferiram entre as fitofisionomias. A Floresta Ombrófila apresentou maior riqueza de espécies em relação aos Campos de Altitude, o que demonstra que a comunidade de mamíferos de médio e grande porte pode ser influenciada pela complexidade ambiental. Com este estudo, foi possível demonstrar que no PNC ocorre uma rica comunidade de mamíferos de médio e grande porte, além de ser abrigo de diversas espécies endêmicas e/ou ameaçadas de extinção da Mata Atlântica.

Composition of a bat assemblage (Mammalia: Chiroptera) in the natural reserve Salto Morato, east coast of Paraná, south Brazil

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Brazilian fauna is characterized by megadiverse groups. Within those, there are bats that are directly responsible for important ecosystem services, such as pollination, dispersion and pest control. Despite of their importance, there are several geographical gaps in the Brazilian bat fauna knowledge. Thus, the present study aimed to analyze the composition of bat assemblage in a Conservation Unit in the Atlantic Forest biome, East Coast of Paraná state, southern Brazil. Samplings were carried out during six nights, in average, per month, between 2013 and 2014. Captures were performed by 18 mist nets installed at different heights in the forest. Reaching sampling sufficiency, we found high species richness (n = 25 spp.), which imply the important role of Conservation Units to maintain bat diversity. The high number of captures (n = 1201) can be explained by sampling in different forest heights, which may indicate the occurrence of spatial variation in habitat use. Moreover, the current results can assist the management and administration of protected areas, as well as the species conservation in situ.

Composição da assembleia de morcegos (Mammalia: Chiroptera) na Reserva Natural Salto Morato, costa oeste do Paraná, sul do Brasil. A fauna brasileira é caracterizada por grupos megadiversos. Dentro desses grupos estão os morcegos, os quais são responsáveis por importantes serviços ecossistêmicos, como polinização, dispersão e controle de pragas. Apesar de sua importância, existem várias lacunas geográficas no conhecimento da fauna de morcegos do Brasil. Assim, o presente estudo teve como objetivo analisar a composição da assembleia de morcegos em uma Unidade de Conservação no bioma Mata Atlântica, no litoral leste do Paraná, Região Sul do Brasil. As amostragens foram realizadas entre 2013 e 2014, durante em media por seis noites mensais. As capturas foram realizadas por 18 redes de neblina instaladas em diferentes alturas na floresta. Atingindo a suficiência amostral, encontramos alta riqueza de espécies (n = 25 spp.), o que implica o importante papel das Unidades de Conservação na manutenção da diversidade de morcegos. O grande número de capturas (n = 1201) pode ser explicado pela amostragem em diferentes alturas na floresta, o que pode indicar ocorrência de variação espacial no uso do habitat. Além disso, os resultados atuais podem auxiliar no gerenciamento e administração de áreas protegidas, bem como na conservação de espécies in situ.

Atividade reprodutiva e estrutura populacional de Myotis nigricans (Schinz, 1821) (Chiroptera: Vespertilionidae) no sul do Brasil

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Dentre os mamíferos, os morcegos compõem o grupo com a maior diversidade de estratégias reprodutivas. Nesse estudo, analisamos as características reprodutivas e a estrutura populacional de Myotis nigricans nos 12 meses do ano, em uma região de clima temperado no sul do Brasil. Nós desenvolvemos o estudo em um abrigo antrópico, localizado no município de Pedras Grandes, no estado de Santa Catarina. Nós capturamos os morcegos mensalmente com redes de neblina instaladas na saída do abrigo e identificamos os indivíduos capturados quanto ao sexo, condição reprodutiva e classe etária. O tamanho populacional estimado da colônia variou de 596 à 1050 indivíduos. Os nascimentos ocorreram principalmente entre os meses de setembro e janeiro, com mais de um evento de gravidez, caracterizando padrão poliéstrico sazonal e bimodal de reprodução. O período reprodutivo de M. nigricans no sul do Brasil assemelha-se ao registrado para outras regiões, todavia, não é possível descrever um padrão único ao longo da área de distribuição da espécie.

Reproductive activity and population structure of Myotis nigricans (Schinz, 1821) (Chiroptera: Vespertilionidae) in the southern Brazil. Among mammals, bats present the greatest diversity in reproductive strategies. In this study we analyzed reproductive and population characteristics of Myotis nigricans over one year in a temperate region in Brazil. We carried out the samplings in an anthropic roost, in Pedras Grandes municipality, Santa Catarina state. We captured bats monthly with mist nets installed at the roosts exits and identified the captured individuals according to sex, reproductive condition and age. There was greatest number of females than males. Population size was estimated from 569 to 1050 individuals. Births occurred mainly from September to January, with more than one pregnancy event along the year, evidencing a seasonal and bimodal polyestry pattern. The reproductive period of M. nigricans in southern Brazil is similar to the records made in other regions. Despite of it, there is no pattern along its distribution range.

First coprological survey of helminths in a wild population of black capuchin monkeys (Sapajus nigritus) in Northeastern Argentina

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Parasites play an important role in primate ecology. Although gastrointestinal parasites have been surveyed in several primate taxa, there is still a substantial paucity of data for some species. Here we report the first coprological survey of helminths in a primate species, the wild black capuchin monkey (Sapajus nigritus), which is endemic to the Atlantic Forest. During three winters and one summer, we collected 665 faecal samples from 44 identified individuals of two capuchin groups in Iguazú National Park, NE Argentina, for parasitological analysis. Overall, we identified eight helminths: Filariopsis sp., Strongyloides sp., Trichuris sp., Ascaris sp., a Subuluridae, a Physalopteridae, a Hymenolepididae cestode, and an undetermined Trematode. The Hymenolepididae (25–42%), Filariopsis sp. (15–42%), and Strongyloides sp. (11–27%) were the most prevalent parasites regardless of the survey year, group and season. On average, infected capuchins harboured 1.12–1.26 parasite taxa. The parasite community observed in the black capuchin monkeys resembled those found in other Cebidae.

Primer estudio coprológico de helmintos en una población silvestre de monos caí (Sapajus nigritus) en el nordeste de Argentina. Los parásitos juegan un rol importante en la ecología de los primates. Aunque los parásitos gastrointestinales han sido investigados en varios taxa de primates, todavía existe un vacío de información para algunas especies. Aquí reportamos los resultados del primer estudio coprológico de helmintos en una población silvestre de monos caí (Sapajus nigritus), una especie endémica del Bosque Atlántico. Durante tres inviernos y un verano, colectamos 665 muestras fecales de 44 individuos identificados pertenecientes a dos grupos de monos caí en el Parque Nacional Iguazú en el Nordeste de Argentina, para realizar análisis parasitológicos. En total identificamos ocho helmintos: Filariopsis sp., Strongyloides sp., Trichuris sp., Ascaris sp., un Subuluridae, un Spiruridae, un cestode Hymenolepididae y un Trematode indeterminado. Hymenolepididae (25–42%), Filariopsis sp. (15–42%) y Strongyloides sp. (11–27%) fueron los parásitos más prevalentes independientemente del año y la estación. En promedio, los monos caí infectados presentaron entre 1.12–1.26 taxa de helmintos. La comunidad de parásitos que encontramos presenta similitudes con la de otros Cebidae.

Roadkill and new records for giant armadillo (Priodontes maximus) in Central-Western Brazil

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Despite the widespread distribution of the giant armadillo Priodontes maximus, this species is found at low densities, often in disrupted populations. Here we report 12 new records, including five incidents of roadkill of P. maximus in different points of the Cerrado and one in an Atlantic Forest fragment in central-western Brazil. In addition to the relevant records, we discuss the negative effects of roadkills, which is a serious issue for the conservation and maintenance of local populations of giant armadillo.

Atropelamentos e novos registros para tatu-canastra (Priodontes maximus) no centro-oeste do Brasil. Apesar da ampla distribuição do tatu-canastra Priodontes maximus, esta espécie apresenta baixas densidades em populações não conectadas. Aqui, relatamos 12 novos registros, incluindo cinco atropelamentos rodoviários de P. maximus em diferentes pontos de Cerrado e um em fragmento de Floresta Atlântica no centro-oeste do Brasil. Além dos registros relevantes, discutimos o efeito negativo da perda de espécimes por atropelamentos em estradas, o qual é um problema sério para a conservação e manutenção de populações locais de tatu-canastra.

Variação na dieta de Artibeus lituratus e Sturnira lilium (Chiroptera: Phyllostomidae) em três regiões fitogeográficas no sul do Brasil

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Phyllostomidae possui a maior diversidade morfológica e ecológica dentre os morcegos neotropicais desempenhando importantes papéis em ambientes florestais, tal como a dispersão de sementes. O objetivo do presente estudo foi comparar a dieta de Artibeus lituratus e Sturnira lilium em três regiões fitogeográficas do bioma Mata Atlântica —Floresta Ombrófila Densa (FOD), Floresta Estacional Semidecidual (FES) e Formação Pioneira com Influência Marinha (FPIM)— na Região Sul do Brasil. Os morcegos foram amostrados mensalmente com redes de neblina, seguindo o protocolo padrão para análise de dieta. Analisamos os dados de composição da dieta conforme atributos de riqueza, abundância e similaridade entre as três regiões amostradas (escalonamento multidimensional não métrico – NMDS e Índice de Bray-Curtis). Para A. lituratus e S. lilium o maior número de amostras provém da FES. Em todas as três regiões fitogeográficas, Ficus e Cecropia foram os gêneros mais consumidos por A. lituratus e Solanum por S. lilium. A abundância dos itens alimentares de A. lituratus e S. lilium foi influenciada pelas regiões fitogeográficas com a presença de agrupamentos distintos entre as amostras de FES, FOD e FPIM. A diferenciação da composição das dietas de A. lituratus e S. lilium entre as três fitofisionomias analisadas corrobora a hipótese de que a estrutura da vegetação influencia a composição da dieta dos morcegos. Essa diferença pode ser detectada apenas quando os itens alimentares são identificados em nível de espécie ou morfo-espécie.

Variation of the diet of Artibeus lituratus and Sturnira lilium (Chiroptera: Phyllostomidae) in three phytogeographic regions of southern Brazil. The family Phyllostomidae has the greatest morphological and ecological diversity among Neotropical bats, playing important roles in forest environments. This study aimed to compare the diet of Artibeus lituratus and Sturnira lilium in three phytophysiognomies in the Atlantic Forest biome in Southern Brazil — Ombrophilous Dense Forest (FOD), Semideciduous Seasonal Forest (FES), and Restinga (FPIM). Bats were sampled monthly along a year using mist nets. Bat’s diet was analyzed in feces following a standardized protocol. We analyzed data on diet composition by richness, abundance and similarity among the three sampled regions (Non-metric Multidimensional Scaling and Bray-Curtis Index). Samples from FES were the most abundant for both A. lituratus and S. lilium, with Ficus and Cecropia being the most consumed genera for the first species and Solanum for the second one in all sampled sites. The abundance of feeding items varied across phytogeographic regions.

First record of Dipetalonema robini Petit, Bain & Roussilhon 1985 (Nematoda: Onchocercidae) parasitizing Sapajus nigritus in northeastern Argentina

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Species of the genus Dipetalonema are filarial parasites of Neotropical monkeys. Herein, we report the first record of Dipetalonema robini from Argentina and from the black horned capuchin monkey, Sapajus nigritus, providing additionally information on its morphology. Nematodes were found in the abdominal cavity of a male capuchin monkey found in the Parque Nacional Iguazú, Misiones, Argentina. Among Dipetalonema species, the proportion of the different parts of the left spicule (handle and lamina; membranous alae and filament) is a character of taxonomic relevance. The membranous ala is longer than the filament in the single male parasite examined, differing from published data. The differences observed could be due to the small number of specimens measured.

Primer registro de Dipetalonema robini Petit, Bain & Roussilhon 1985 (Nematoda: Onchocercidae) parásito de Sapajus nigritus en el noreste de Argentina. Las filarias del género Dipetalonema son parásitos de monos neotropicales. En este trabajo reportamos el primer registro de Dipetalonema robini para la Argentina y para el mono caí, Sapajus nigritus, además de proveer nuevos datos de la morfología de la especie. Tres filarias fueron encontradas en la cavidad abdominal de un mono caí macho hallado en el Parque Nacional Iguazú, Misiones, Argentina. Un carácter taxonómico relevante entre las especies de Dipetalonema es la proporción de las diferentes partes de la espícula izquierda (mango y lámina; alas membranosas y filamento). En el macho hallado, la sección de alas membranosas es más larga que el filamento, difiriendo con los datos publicados. Esta diferencia puede deberse al pequeño número de ejemplares medidos.

New records of Micronycteris schmidtorum Sanborn, 1935 (Phyllostomidae, Chiroptera) for northeastern Brazil

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We present three new records of Micronycteris schmidtorum for the Atlantic Forest of northeastern Brazil. An adult female was collected in the Serra de Itabaiana National Park, Sergipe State; a post-lactating female was caught in the Reserva Particular do Patrimônio Natural Sitio Pau-Brasil, Coruripe, Alagoas State; and an adult female was collected in the Reserva Biológica Guaribas, Paraiba State. These records fill a gap of approximately 800 km between previously known localities of the species.

Novos registros de Micronycteris schmidtorum Sanborn, 1935 (Phyllostomidae, Chiroptera) para o Nordeste do Brasil. Apresentamos três novos registros de Micronycteris schmidtorum para a Floresta Atlântica do Nordeste do Brasil. Uma fêmea adulta foi coletada no Parque Nacional Serra de Itabaiana, Sergipe; uma fêmea pós-lactante foi capturada na Reserva Patricular do Patrimônio Natural Sítio Pau-Brasil, Coruripe, Alagoas; e uma fêmea adulta foi coletada na Reserva Biológica Guaribas, Paraíba. Nossos registros preenchem uma lacuna de aproximadamente 800 km entre os registros prévios conhecidos da espécie.

New records of Lampronycteris brachyotis in Brazil

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Lampronycteris is a monotypic genus distributed throughout the Neotropical region. Brazil presents the largest number of reports of L. brachyotis, most of which occur within Amazonia, with only limited records in Cerrado and Atlantic Forest. The present report provides an updated distribution of L. brachyotis in these three biomes, including the first records for the states of Rondônia and Goiás and additional records in the states of Mato Grosso, Pará and São Paulo. We highlight that mesic areas in open formations such as Cerrado might support relictual populations of L. brachyotis, highlighting the importance of these areas for bat diversity.

Nuevos registros de Lampronycteris brachyotis en Brasil. Lampronycteris es un género monotípico de amplia distribución en la región neotropical. Brasil tiene el mayor número de registros de L. brachyotis concentrados en la Amazonía y solo unos pocos registros en el Cerrado y Bosque Atlántico. Este artículo ofrece una actualización de la distribución de L. brachyotis en estos tres biomas, con el primer registro en Rondônia y Goiás, y registros adicionales en los estados de Mato Grosso, Pará y São Paulo. Con los registros presentados aquí, destacamos que los ambientes mésicos presentes en bosque estacional seco, como el Cerrado, pueden mantener poblaciones relictuales de L. brachyotis, destacando la importancia de estas áreas para la diversidad de murciélagos.