Review of impacts of fossorial rodents on soil and vegetation in North and South America

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Fossorial rodents are ecosystem engineers who significantly alter soil properties and vegetation. We review the impacts of fossorial rodents on soil and vegetation in North and South America based on a comprehensive review of the scientific literature from 1980 to 2021, recording the number of publications. Also, we recorded the number of publications classiffied by habitat. We classiffied the variables associated with soil and vegetation impacts to identify research gaps and trends. Additionally, after filtering publications that compared undisturbed and rodent-disturbed areas, we compared these areas to quantify the impact caused by rodents. We found 203 research publications, with a higher number in North America, although South American research has increased in recent decades. Pocket gophers (Geomyidae) were the most studied group in North America of fossorial rodents, while tuco-tucos (Ctenomys) were in South America. Soil variables such as mound and burrow volume, excavation rate, mound area and density, moisture content, and nitrogen content were the most studied, along with vegetation variables such as biomass, cover, diversity, and richness. Variability in soil removal and the surface of the soil removed was observed across different rodent species. Rodent-disturbed areas exhibited lower soil compaction, bulk density, moisture content, and native plant cover, while soil temperature and exotic plant cover were higher. This review enhances understanding of fossorial rodent impacts on soil and vegetation in North and South America and underscores areas in need of further research.


Revisión del impacto de los roedores fosoriales en el suelo y la vegetación de América del Norte y Sur. Los roedores fosoriales son ingenieros ecosistémicos que alteran el suelo y la vegetación. Revisamos sus impactos en el suelo y la vegetación en América del Norte y Sur mediante una revisión exhaustiva de la literatura científica desde 1980 hasta 2021, y registramos el número de publicaciones. Registramos también el número de publicaciones clasificadas por hábitat. Clasificamos las variables asociadas con los impactos en el suelo y la vegetación para identificar brechas y tendencias en la investigación. Además, comparamos áreas no disturbadas y disturbadas por roedores para cuantificar sus impactos. Encontramos 203 publicaciones de investigación, con un número mayor en América del Norte, aunque la investigación en América del Sur ha aumentado en las últimas décadas. Las tuzas de bolsillo (Geomyidae) y los tuco-tucos (Ctenomys) fueron los más estudiados en América del Norte y Sur, respectivamente. Las variables del suelo, como el volumen de montículos y madrigueras, la tasa de excavación, el área y densidad de montículos, el contenido de humedad y nitrógeno fueron las más estudiadas, junto con variables de vegetación, como la biomasa, cobertura, diversidad y riqueza. Observamos variabilidad en la remoción del suelo y la superficie de suelo removido entre las especies. Las áreas disturbadas mostraron menor compactación del suelo, densidad aparente, contenido de humedad y cobertura de plantas nativas, mientras que la temperatura del suelo y la cobertura de plantas exóticas fueron mayores. Esta revisión mejora la comprensión de los impactos de los roedores fosoriales en América del Norte y Sur, y destaca áreas que requieren más investigación.

Graphical abstract for the article “Review of impacts of fossorial rodents on soil and vegetation in North and South America” (Acebal-Ghiorzi et al., 2024)

Abundance and habitat preferences of house mouse Mus musculus in the desert of northern Peru

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The house mouse is a commensal species that invades natural ecosystems and threatens both native rodents and ecosystems. Therefore, it is important to describe the population of Mus musculus in native ecosystems to develop effective management plans for eradicating or controlling this species. In this study, we assessed the abundance and habitat preferences of M. musculus in Reserva Nacional de Illescas (RNI) and Manglares de San Pedro de Vice (MSPV) using capture-recapture methods during 2021 and 2022. We recorded only a few captures (N = 3) of M. musculus in the RNI, whereas numerous captures and recaptures (N = 195 and N = 41, respectively) were recorded at the MSPV. Our analysis suggests that M. musculus prefers complex habitats. We discuss the implications of the presence of house mice in mangrove ecosystems and emphasize the population dynamics of this species for its control and management in legally protected areas. In conclusion, the population size of the house mouse varies among different habitats, with a preference for complex environments.


Abundancia y preferencias de hábitat del ratón doméstico Mus musculus en el desierto del norte del Perú. El ratón doméstico es una especie comensal que invade ecosistemas naturales y amenaza tanto a las especies nativas de roedores como a los ecosistemas. Por lo tanto, es importante describir la población de Mus musculus en ecosistemas nativos para diseñar planes de manejo efectivos con el objetivo de erradicar o controlar esta especie. En este estudio, evaluamos la abundancia y las preferencias de hábitat de M. musculus en la Reserva Nacional de Illescas (RNI) y en los Manglares de San Pedro de Vice (MSPV), usando métodos de captura-recaptura durante 2021 y 2022. Registramos algunas capturas de M. musculus en la RNI y numerosas capturas y recapturas de esta especie en los MSPV, y estimamos que M. musculus prefiere hábitats más complejos. Discutimos las consecuencias de la presencia del ratón doméstico en los manglares y resaltamos los aspectos poblacionales de esta especie para su control y manejo en áreas de conservación. Concluimos que el ratón doméstico varía el tamaño población entre los diferentes hábitats y muestra preferencia por hábitats complejos.

Graphical abstract for the article “Abundance and habitat preferences of house mouse (Mus musculus) in the desert of northern Peru” (Carrasco-Escudero et al., 2024)

Bat community structure in urban green areas of northeastern Brazil

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The structure of the habitat can influence the bat community, limiting the species to use certain environments. Considering the more tolerant species, these can be found in forest fragments surrounded by urban matrix or heavily wooded places. This study aimed to characterize the bat community in the urban green areas of Greater Aracaju, Sergipe. The campaigns were conducted during two consecutive monthly nights in each area. Bats were captured using 10 mist nets. The abundance, richness, diversity, and composition of bats were characterized for each area. In addition, the models of abundance and sufficiency of the sampling effort were evaluated. We captured 599 individuals, representing 13 species in three families, with an effort of 77.760 m²/h. Secretaria de Estado da Fazenda de Sergipe had the highest value of the diversity index (H’ = 1.78), followed by Universidade Federal de Sergipe (H’ = 1.62) and Vila Militar dos Officiais do Exército (H’ = 1.55), with a difference observed only between the SEFAZ and Vila areas. The observed richness was lower than expected in all areas. Only the UFS and SEFAZ differed in species composition. For urban green areas in the state, Artibeus planirostris and Myotis riparius correspond to the new records. The observed difference in diversity between the SEFAZ and Vila may be associated with the greater evenness of the SEFAZ and the dominance of Artibeus lituratus in Vila. This study provides relevant information on the subject, highlighting the need to obtain a better understanding of this group in urban green environments.


Estrutura da comunidade de morcego em áreas verdes urbanas do nordeste do Brasil. A estrutura do habitat pode influenciar a comunidade de morcegos, limitando a espécie a utilizar determinados ambientes. Considerando as espécies mais tolerantes, estas podem ser encontradas em fragmentos florestais circundados por matriz urbana ou locais fortemente arborizados. Este estudo teve como objetivo caracterizar a comunidade de morcegos nas áreas verdes urbanas da Grande Aracaju, Sergipe. As campanhas foram realizadas durante duas noites mensais consecutivas em cada área. Os morcegos foram capturados com 10 redes de neblina. Para cada área, foram caracterizadas a abundância, riqueza, diversidade e composição de morcegos. Além disso, foram avaliados os modelos de abundância e suficiência do esforço amostral. Foram capturados 599 indivíduos, representando 13 espécies de três famílias, com um esforço de 77,760 m².h. A Secretaria de Estado da Fazenda de Sergipe apresentou o maior índice de diversidade (H’ = 1,78), seguida pela Universidade Federal de Sergipe (H’ = 1,62) e Vila Militar dos Oficiais do Exército (H’ = 1,55), com diferença observada apenas entre as áreas SEFAZ e Vila. A riqueza observada foi menor que a esperada em todas as áreas. Apenas a UFS e a SEFAZ diferiram na composição de espécies. Para as áreas verdes urbanas do estado, Artibeus planirostris e Myotis riparius correspondem aos novos registros. A diferença de diversidade observada entre a SEFAZ e a Vila pode estar associada à maior equitabilidade da SEFAZ e à predominância de Artibeus lituratus na Vila. Este estudo fornece informações relevantes sobre o assunto, destacando a necessidade de se obter um melhor conhecimento desse grupo em ambientes verdes urbanos.

Graphical abstract for the article “Bat community structure in urban green areas of northeastern Brazil” (Santos Bezerra & Bocchiglieri, 2024)

Patrones reproductivos de tres especies de filostómidos del Bosque Atlántico Interior del Paraguay

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La caracterización de los patrones reproductivos aporta valiosa información acerca de la ecología de organismos que, a su vez, pueden contribuir a la conservación y el manejo de especies. Desafortunadamente se conoce muy poco acerca de los patrones reproductivos de muchas especies de murciélagos neotropicales. Aquí describimos los patrones reproductivos de tres especies de murciélagos del Bosque Atlántico Interior del Paraguay: Artibeus lituratus, Sturnira lilium y Pygoderma bilabiatum. En estas tres especies de murciélagos las hembras mostraron poliestría bimodal estacional y sincrónica. Los machos también exhibieron dos picos reproductivos anuales, aunque no tan prominentes como los de las hembras. La pronunciada estacionalidad del Bosque Atlántico Interior puede causar no solo la sincronía reproductiva intraespecífica, sino también la interespecífica, debido a que la reproducción queda restringida a una época del año.


Reproductive patterns of three species of philostomids from the interior Atlantic Forest of Paraguay. Characterizing reproductive patterns can provide important insights into the ecology of organisms that can ultimately be used to conserve and manage species. Unfortunately, for many Neotropical bat species, little is known regarding reproductive patterns, let alone geographic variation in such important life history characteristics. We describe reproductive patterns for three species of bats (Artibeus lituratus, Sturnira lilium, and Pygoderma bilabiatum) from the interior Atlantic Forest of Paraguay. For all three species, females exhibited synchronous, seasonally bimodal polyestry, and males, while not as conspicuous, also exhibited two reproductive peaks. Pronounced seasonality in the interior Atlantic Forest may cause not only synchrony of reproduction within species but also the appearance of synchrony among species because of the curtailment of reproduction to only a portion of the year.

Graphical abstract for the article “Patrones reproductivos de tres especies de filostómidos del Bosque Atlántico Interior del Paraguay” (Stevens et al., 2024)

La influencia de la variabilidad genética, los costos energéticos y los compromisos funcionales sobre la respuesta a infecciones en tuco-tucos (Ctenomys talarum)

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Los organismos están expuestos a patógenos causantes de infecciones y, en consecuencia, desarrollan respuestas fisiológicas complejas que les permiten resistir o eliminar esas amenazas. Este conjunto de estrategias constituye el sistema inmune. Asimismo, los hospedadores exhiben una gran variación en la magnitud y eficiencia de sus respuestas inmunes. La ecoinmunología es una disciplina emergente que intenta comprender cuáles son los factores intrínsecos y extrínsecos que modulan esa variación en la respuesta inmune y, por lo tanto, en la susceptibilidad a enfermedades en un amplio abanico de especies y hábitats. Por un lado, existe numerosa evidencia de que la resistencia a patógenos se encuentra bajo control genético. Por el otro, dado que la función inmune involucra costos elevados (p. ej., energéticos y nutricionales), se espera que surjan compromisos entre este y otros procesos fisiológicos costosos para el organismo. En esta revisión se presentan los principales patrones de variación del complejo de histocompatibilidad (MHC) y su relación con la resistencia a patógenos en el roedor subterráneo Ctenomys talarum (tuco-tucos), así como también su papel en el contexto de selección de pareja. Además, se presenta evidencia de la existencia de costos energéticos y nutricionales de diferentes brazos de la respuesta inmune de esta especie y los compromisos que se establecen entre la función inmune y otros procesos fisiológicos, como la reproducción. Finalmente, se discuten los roles del hábitat y los rasgos de historia de vida en el modelado de la variación de la respuesta inmune en tuco-tucos y la relevancia de los estudios ecoinmunológicos en mamíferos silvestres.


The influence of genetic variability, energetic costs, and functional trade-offs on the response to infections in tuco-tucos (Ctenomys talarum). Organisms are exposed to pathogens that cause infections, and consequently, they have developed complex physiological responses that allow them to resist or eliminate such threats; this set of strategies constitutes the immune system. Hosts exhibit great variation in the magnitude and efficiency of their immune responses. Ecoimmunology is an emerging discipline that seeks to understand the intrinsic and extrinsic factors that modulate this variation in immune response and, therefore, susceptibility to diseases across a wide range of species and habitats. On one hand, there is ample evidence that resistance to pathogens and parasites is under genetic control. On the other hand, since immune function involves high costs (e.g., energy, nutritional), it is expected that trade-offs arise between it and other costly physiological processes for the organism. In this review, the main patterns of variation in the major histocompatibility complex (MHC) and its relationship with pathogen resistance in the subterranean rodent Ctenomys talarum (tuco-tucos) are presented, as well as the role of these genes in the context of mate selection. Additionally, evidence is presented for the existence of energy and nutritional costs of different arms of the immune response in this species, as well as the trade-offs established between immune function and other physiological processes, such as reproduction. Finally, the roles of habitat and life history traits in shaping the variation of the immune response in tuco-tucos are discussed, along with the relevance of ecoimmunological studies in wild mammals.

Graphical abstract for the article “La influencia de la variabilidad genética, costos energéticos y compromisos funcionales sobre la capacidad de responder a infecciones en tuco-tucos (Ctenomys talarum)” (Cutrera et al., 2024)

Trophic ecology of Geoffroy’s cat (Leopardus geoffroyi) and mammal prey availability in semi-arid environments of central Patagonia, Argentina

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Research on the dietary composition of felids can help improve the perception of rural workers and their tolerance towards this group, which is threatened by human-wildlife conflicts. In this context, the purpose of this study was to quantify the diet of Leopardus geoffroyi in Península Valdés (Patagonia, Argentina) to obtain baseline knowledge of the species’ dietary habits, trophic ecology, and degree of prey consumption. To this end, 160 fresh scat samples, collected from 2013 to 2016, were analyzed. Ten mammal species, one tinamou bird, one lizard genus, and one insect order were identified. The most frequently consumed prey (63.84%) were small-sized mammals (< 1 kg), accounting for the highest biomass contribution (37.2%). The frequency of each mammal species in the diet was not correlated with their capture frequency (measured through Sherman live traps and pedestrian diurnal transects). This study is the first to report on the diet of L. geoffroyi in Argentinean central Patagonia, and it provides information not only on ecological aspects but also on the natural history of this felid species.


Ecología trófica del gato montés (Leopardus geoffroyi) y disponibilidad de presas de mamíferos en ambientes semiáridos de la Patagonia central, Argentina. La investigación sobre la composición de la dieta de los felinos puede ayudar a mejorar la percepción y la tolerancia de los trabajadores rurales hacia esta especie de carnívoro felino que se ve amenazada por el conflicto entre humano-vida silvestre. En este contexto, el propósito de este estudio fue cuantificar la dieta de Leopardus geoffroyi en Península Valdés (Patagonia, Argentina) con la finalidad de obtener un conocimiento básico sobre la ecología trófica y el grado de consumo de presas. Para ello, se analizaron 160 muestras de heces frescas recogidas entre 2013 y 2016. Se identificaron 10 especies de mamíferos, una especie de tinamú, un género de lagarto y un orden de insecto. Se encontró que las presas consumidas con mayor frecuencia (63.84%) eran los mamíferos de pequeño tamaño (< 1 kg) que, a su vez, representaron la mayor contribución de biomasa (37.2%). La frecuencia de cada especie de mamífero en la dieta no se correlacionó con su frecuencia de captura (medida a través de trampas de captura viva tipo Sherman y transectos diurnos pedestres). Este trabajo es la primera aproximación a la dieta de L. geoffroyi realizada en la Patagonia central argentina y aporta conocimientos no solo sobre aspectos ecológicos, sino también sobre la historia natural de esta especie de felino.

Graphical abstract for the article “Trophic ecology of Geoffroy’s cat (Leopardus geoffroyi) and mammal prey availability in semi-arid environments of central Patagonia, Argentina” (D'Agostino & Udrizar Sauthier, 2024)

Recent large-scale environmental suitability and structural connectivity of the Andean cat Leopardus jacobita across its distribution: a first approach

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The years between 2013 and 2021 were classiffied as the warmest on record. Mountain ecosystems are extremely vulnerable to these anomalies of temperature, and, additionally, extractive and infrastructure projects represent great threats to these environments. Protected Areas (PAs) are one of the conservation tools applied to overcome these threats, which is particularly relevant for rare and elusive species. The Andean cat is an endangered felid that inhabits these mountainous habitats, and where its conservation has become a great challenge in the last years. Here, we complete a first approximation of the i) habitat suitability (HS) and structural connectivity of the species across its distribution during the last decade, and we ii) spatially describe how PAs and Mining Resources (MRs) distribute on the HS and connectivity map. The Andean cat HS values (HSv) increased with decreasing mean annual air temperatures, NDVI and annual precipitation, the presence of bare and sparse vegetation, snow, and ice land covers, and increasing slope degrees. The areas with the highest HSv were located along the Andean mountains. The maximum area covered by the MRs and PAs was in HSv between 61% and 80%. The “diffuse current flow” (dcf) was located in the Andean mountains, while the “channeled current flow” (ccf) was found in the south-east of Peru, on the east side of the Andean Knee, from South Bolivia to North Argentina, and in central areas of Argentina. The maximum area covered by the MRs and PAs was characterized by “dcf”. This study needs to be complemented with functional connectivity analyses at the local scale to comprehend the design and management of potential corridors for this species.


Estimación a gran escala y reciente de la idoneidad ambiental y conectividad estructural del gato andino Leopardus jacobita a lo largo de su distribución: una primera aproximación. Los años 2013 a 2021 fueron registrados como los más cálidos. Los ecosistemas montañosos son extremadamente vulnerables a estas anomalías de temperatura, y los proyectos extractivos y de infraestructura representan grandes amenazas para estos entornos. Las Áreas Protegidas (AP) son una de las herramientas de conservación aplicadas para mitigar estos disturbios, relevantes para especies raras y elusivas. El gato andino es un felino en peligro de extinción que habita estos hábitats, cuya conservación se ha convertido en un gran desafío en los últimos años. Completamos una primera aproximación de i) la idoneidad del hábitat (IH), y la conectividad estructural de la especie a lo largo de su distribución durante la última década, y ii) describimos espacialmente cómo las AP y los Recursos Mineros (RM) se distribuyeron en los mapas de IH y conectividad. Los valores de IH (IHv) aumentaron con la disminución de las temperaturas medias anuales, el NDVI y las precipitaciones anuales, la presencia de vegetación baja y escasa, hielo y nieve, y el aumento de la pendiente. Las áreas con los IHv más altos se ubicaron en la cordillera de los Andes. El área máxima cubierta por los RM y las AP se localizó en valores de IHv entre 61% y 80%. El «flujo de corriente difusa» (fcd) se ubicó en la coordillera de los Andes, mientras que el «flujo de corriente canalizado» (fcc) se localizó en: el sur-este de Perú, hacia el este del Andean Knee, desde el sur de Bolivia hacia el norte de la Argentina, y en la Argentina central. Las áreas cubiertas por los RM y las AP fueron caracterizadas por un «fcd». Este estudio necesita complementarse con análisis de conectividad funcional a escala local para poder comprender el diseño y manejo de potenciales corredores para esta especie.

Graphical abstract for the article “Recent large-scale environmental suitability and structural connectivity of the Andean cat Leopardus jacobita across its distribution: a first approach” (Guerisoli et al., 2024)