Síndrome pulmonar por hantavirus asociado al Orthohantavirus Alto Paraguay en Argentina. Estudio del caso humano y potencial roedor reservorio

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El síndrome pulmonar por hantavirus (SPH) es una enfermedad viral aguda causada por miembros del género Orthohantavirus, familia Hantaviridae. En Argentina, se evidenció la circulación de diversos genotipos patógenos en diferentes roedores reservorios. Asimismo, se han identificado al menos cuatro genotipos no patógenos para humanos. En 2020 se confirmó el diagnóstico de un paciente con SPH, residente en la localidad de Colonia Montefiore (provincia de Santa Fe), sin antecedentes de viaje. El genotipo de orthohantavirus detectado en este paciente fue Alto Paraguay. Este genotipo había sido detectado anteriormente solo en Paraguay en roedores identificados como Holochilus chacarius, pero no en pacientes con SPH. Dado que en Argentina no existían registros sobre la circulación de este genotipo, se realizaron muestreos de la comunidad de roedores en los potenciales sitios de contagio del caso humano. Se capturaron 59 roedores, de los cuales se detectó un individuo de H. chacarius infectado con el genotipo Alto Paraguay. La comparación de las secuencias nucleotídicas de un fragmento de los segmentos genómicos S y M correspondientes al caso humano de SPH y al roedor H. chacarius presentaron un 100% de identidad. Estos resultados confirman la circulación de un nuevo genotipo de orthohantavirus patógeno en Argentina, y aportan evidencias de su potencial asociación con roedores de la especie H. chacarius, información de importancia para la toma de medidas de prevención.


Hantavirus pulmonary syndrome associated with the Orthohantavirus Alto Paraguay in Argentina. Human case study and potential rodent reservoir. Hantavirus pulmonary syndrome (HPS) is an acute viral illness caused by members of the genus Orthohantavirus, family Hantaviridae. In Argentina, there is evidence of the circulation of several pathogenic genotypes in diferent rodent reservoirs. In addition, at least four non-pathogenic genotypes for humans have been identified. In 2020, a patient inhabiting Colonia Montefiore (province of Santa Fe) without any travel history was diagnosed with HPS. The orthohantavirus genotype detected in the patient was Alto Paraguay. This genotype had previously been detected only in Paraguay in rodents identified as Holochilus chacarius, but not in patients with HPS. Since the circulation of this genotype was unknown in Argentina, we studied the rodent communities in rural areas near the site of the human infection case. Fifty-nine rodents were captured, and one specimen of H. chacarius proved to be infected with the Alto Paraguay genotype. The viral sequences of the rodent were compared with those of the patient, finding 100% nucleotide identity for the fragments of the S and M genomic segments. These results confirm the circulation of a new pathogenic genotype of orthohantavirus in Argentina, and provide evidence of its potential association with rodents of the species H. chacarius, important information for prevention measures.

Graphical abstract for the article “Síndrome pulmonar por hantavirus asociado al Orthohantavirus Alto Paraguay en Argentina. Estudio del caso humano y potencial roedor reservorio” (Martin et al., 2024)

Genetic diversity of the white-eared opossum Didelphis albiventris (Didelphimorphia: Didelphidae) in Argentina

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The white-eared opossum Didelphis albiventris Lund, 1840, is one the largest and most common species of marsupial in Argentina, distributed from the north of the country up to Neuquén and Río Negro provinces in the south. The species is present in contrasting environments, such as the Monte (desert) and the Parana Forest (rainforest), and is also adapted to live in large cities and agricultural fields. Although there are some phylogeographic analyses of Brazilian populations of D. albiventris, showing little variation and some geographic structure, up to now none of them included samples from Argentina. The aim of this contribution is to analyze the genetic structure of the species, using two mitochondrial markers (cytochrome b and D-loop) on a wide geographic coverage in Argentina (> 10° S). Results showed little genetic variation and low haplotype diversity, with lesser values than those reported for Brazilian populations. This small variation could be due to a sudden expansion, which is supported by field observations of the species expanding to the south. Unfortunately, the low genetic variability resulted in low statistical power to give conclusive results in the mismatch analysis or the Bayesian skyline plot. Another possibility is high levels of gene flow, which is consistent with the low correlation beween genetic and geographic distances detected in the Mantel test (althogh statistically significant) and the wide home range that the species has. A different approach, using a different set of markers, is needed in order to analyze the phylogeographic history of D. albiventris.


Diversidad genética de la comadreja overa Didelphis albiventris (Didelphimorphia: Didelphidae) en Argentina. La comadreja overa Didelphis albiventris Lund, 1840, es una de las especies de marsupiales más grandes y comunes en Argentina y se distribuye desde el norte del país hasta las provincias de Neuquén y Río Negro en el sur. La especie está presente en ambientes dispares, como el Monte (desierto) y la Selva Paranaense (bosque lluvioso) y también está adaptada a vivir en grandes ciudades y regiones agrícolas. Aunque existen algunos análisis filogeográficos de poblaciones brasileñas de D. albiventris que muestran poca variación y cierta estructura geográfica, hasta el momento ninguno de ellos incluyó muestras provenientes de Argentina. El objetivo de esta contribución es analizar la estructura genética de la especie utilizando dos marcadores mitocondriales (citocromo b y D-loop) y una amplia muestra geográfica proveniente de Argentina (> 10° S). Los resultados mostraron poca variación genética y baja diversidad de haplotipos, con valores inferiores a los descriptos para las poblaciones brasileñas. Esta escasa variabilidad podría deberse a una expansión reciente, hipótesis respaldada por observaciones de campo de la especie expandiéndose hacia el sur. Sin embargo, la baja variabilidad encontrada resultó en una falta de poder estadístico para dar resultados concluyentes en el análisis de Mismatch o en el Bayesian skyline plot. Otra posibilidad serían altos niveles de flujo génico, algo consistente con la baja correlación (aunque estadísticamente significativa) entre distancias genéticas y geográficas en la prueba de Mantel y el amplio rango de acción que tiene la especie. Se necesita un enfoque diferente, utilizando otros marcadores más variables, para analizar la historia filogeográfica de D. albiventris.

Drawings and notes by Elio Massoia. Photo collage by Damián Voglino.

Connectivity among Norway rat subpopulations (Rattus norvegicus) at poultry farms in Exaltación de la Cruz, Buenos Aires, Argentina

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Despite the substantial economic and human health problems produced by rodents of the genus Rattus almost nothing is known about its actual dispersal. In the present study we analyze the genetic subdivision of R. norvegicus inhabiting poultry farms of Buenos Aires, Argentina, and the relation between geographic and genetic distances by means of variation in microsatellite loci. We genotyped 40 rats captured between April-06 and June-07 from nine poultry farms distributed in an area of 110 km². No genetic subdivision was found among different poultry farms. This result supports the hypothesis of high connectivity between R. norvegicus inhabiting poultry farms in Buenos Aires. Because this species is a known host of diverse zoonosis as leptospirosis and trichinosis, our results point out that there is a great risk of transmission for distances lower than 12 km. Health control and preventive measures should therefore be applied simultaneously in all nearby poultry farms.


Conectividad entre las subpoblaciones de rata noruega (Rattus norvegicus) que habitan granjas avícolas de Exaltación de la Cruz, Buenos Aires, Argentina. A pesar de los problemas económicos y de salud producidos por roedores del género Rattus, se conoce muy poco sobre su dispersión efectiva. En el presente estudio analizamos la subdivisión genética de las subpoblaciones de R. norvegicus que habitan granjas avícolas de Buenos Aires, Argentina, y la relación entre las distancias geográficas y genéticas por medio de la variabilidad en loci de microsatélites. Se genotiparon 40 ratas capturadas entre abril-06 y junio-07 en nueve granjas avícolas distribuidas dentro de un área de 110 km². No se encontró subdivisión genética entre las diferentes granjas avícolas. Esto apoya la hipótesis de alta conectividad entre R. norvegicus que habitan granjas avícolas en Buenos Aires. Debido a que R. norvegicus es un conocido hospedador de diversas zoonosis como leptospirosis y triquinosis, nuestros resultados indican que existe un gran riesgo de transmisión para distancias menores a 12 km. Las medidas de control y prevención sanitarias deberían, por lo tanto, aplicarse en todas las granjas cercanas en forma simultánea.

Notes on the taxonomy of Calomys laucha (Rodentia, Cricetidae), with the designation of a neotype

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Calomys laucha (Fischer, 1814) is a small phyllotine rodent (< 20 g), broadly distributed from northern Paraguay and southeastern Bolivia to southern Brazil, Uruguay and central Argentina. We provide an update on the genetic composition of this species. Our results support previous findings and indicate that C. laucha is composed of two main clades, one encompassing populations of southern Brazil, Uruguay and the Argentinean Mesopotamia, and another including those from the remainder of the distribution in Argentina, Bolivia and Paraguay. The boundary between these groups appears to converge along the Paraná–Paraguay rivers, which we presume act as a geographic barrier. As in other species of mammals described by Félix de Azara, the type locality of C. laucha is uncertain. Previous authors restricted it to eastern Paraguay based partially on historical misinterpretations. This restriction is inappropriate because currently only Calomys tener is recorded there. To stabilize the taxonomy of C. laucha we designate a neotype for the species, fixing with this act its terra typica to a locality in northern Buenos Aires province, in central-eastern Argentina.


Notas sobre la taxonomía de Calomys laucha (Rodentia, Cricetidae), con la designación de un neotipo. Calomys laucha (Fischer, 1814) es un pequeño roedor filotino (< 20 g), ampliamente distribuido desde el norte de Paraguay y el sureste de Bolivia hasta el sur de Brasil, Uruguay y el centro de Argentina. En esta contribución ofrecemos una actualización sobre la composición genética de esta especie. Nuestros resultados apoyan hallazgos previos que indican que la especie está compuesta por dos clados principales: uno que abarca las poblaciones del sur de Brasil, Uruguay y la Mesopotamia argentina, y otro que incluye las del resto de Argentina, Bolivia y Paraguay. Los límites entre ambos grupos parecen estar relacionados con los ríos Paraná–Paraguay, que actuarían como barrera geográfica. Al igual que en otras especies de mamíferos descritas por Félix de Azara, la localidad tipo de C. laucha es incierta. Autores previos la restringieron al este de Paraguay, basándose parcialmente en interpretaciones históricas erróneas. Esta restricción es inapropiada, porque según nuestro conocimiento actual solo C. tener estaría presente allí. Para estabilizar la taxonomía de C. laucha hemos designado un neotipo para este taxón, fijando con este acto su terra typica a una localidad en el norte de la provincia de Buenos Aires, centro-este de Argentina.

Resúmenes de tesis

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Ana C. Delciellos | Desempenho arborícola e nicho locomotor potencial de sete espécies de marsupiais (Didelphimorphia) da Mata Atlântica


Carl W. Dick | Ecology and host specificity of bat flies (Diptera: Treblidae) and their chiropteran hosts


Carlos E. Lustosa Esbérard | Morcegos no estado do Rio de Janeiro


Raúl E. González Ittig | Estructura poblacional de Calomys musculinus (Rodentia, Muridae) estimada mediante polimorfismos en el ADN mitocondrial