Keyword: taxonomy

Taxonomía de los primates de Colombia: cambios en los últimos veinte años (2000–2019) y anotaciones sobre localidades tipo

,

Colombia es uno de los países con mayor riqueza de primates en el mundo. Sin embargo, el número e identidad de las especies ha sido un tema debatido a lo largo de los años. Las primeras descripciones de primates colombianos se remontan a expediciones posteriores a la conquista española. A esto se sumaron las primeras revisiones taxonómicas de géneros y especies en la primera mitad del siglo XX, a partir de literatura y especímenes de museo. Con el objetivo de unificar la información taxonómica de los primates no humanos del país, realizamos una revisión de literatura enfocada en aquellos aportes que han llevado a cambios en los arreglos taxonómicos y nomenclaturales de los últimos 20 años. Además, reunimos información sobre los taxa con localidad tipo en Colombia a partir de revisiones de las descripciones originales. En total, reconocemos la presencia de 36 especies y 17 subespecies, donde los mayores cambios se han dado en los géneros Cebus y Aotus. Reportamos ocho especies endémicas, y 25 taxa con localidades tipo en el país. Consideramos que, de acuerdo con revisiones recientes, las poblaciones del género Cacajao en el país corresponden a C. ouakary (Spix 1823) y, ante la ausencia de evidencia molecular, barreras geográficas y diferenciación fenotípica, indicamos a Pithecia milleri como subpespecie de P. hirsuta (Spix 1823), y a Cheracebus lucifer y C. medemi como subespecies de C. torquatus (Hoffmannsegg, 1807). Finalmente, proponemos el uso de subgéneros para representar las relaciones evolutivas en Saguinus (Leontocebus) y Callicebus (Plecturocebus, Cheracebus).

Taxonomy of Colombian primates: changes in the last twenty years (2000–2019) and some taxonomic notes. Colombia is among the countries with the greatest richness of primates in the world. However, the number and identity of species has been a debated topic over the years. The first descriptions of Colombian primates date back to expeditions after the Spanish conquest. Later, the first taxonomic reviews of genera and species were published in the first half of the 20th century, based on literature and museum specimens. To unify the taxonomic information of non-human primates of the country, we conducted a literature review focused on those contributions that have led to changes in the taxonomic and nomenclatural arrangements of the last 20 years. Also, we collected information on taxa with type locality in Colombia from revisions of the original descriptions. We recognize the presence of 36 species and 17 subspecies, where the greatest changes have occurred in the genera Cebus and Aotus. We report 8 endemic species and 25 taxa with type localities in the country. Furthermore, we consider that, according to recent reviews, the populations of the genus Cacajao in the country correspond to C. ouakary (Spix 1823) and, in the absence of molecular evidence, geographic barriers, and phenotypic differentiation, we indicate Pithecia milleri as a subspecies of P. hirsuta (Spix, 1823), and Cheracebus lucifer and C. medemi as subspecies of C. torquatus (Hoffmannsegg, 1807). Finally, we propose the use of subgenera to represent the evolutionary relationships in Saguinus (Leontocebus) and Callicebus (Plecturocebus, Cheracebus).

Código de barras de ADN para la delimitación de especies en roedores sigmodontinos (Cricetidae) del norte argentino, con especial énfasis en aquellas de las Yungas

, , , ,

En esta investigación usamos códigos de barras de ADN como una herramienta para el análisis de la diversidad específica y la variabilidad geográfica de roedores Sigmodontinae (Cricetidae) en el norte de Argentina. Analizamos 162 individuos de 50 localidades pertenecientes a 31 especies originalmente determinadas mediante morfología. El 72% de las localidades estudiadas se encuentran en las Yungas mientras que el 71% de las especies analizadas habita en alguno de sus estratos altitudinales. Se realizaron dos análisis de delimitación de especies: la implementación bayesiana del método «Poisson Tree Processes» (bPTP) y el método «Automated Barcode Gap Discovery» (ABGD), este último bajo dos modelos de sustitución, K2P y JC69. El método bPTP evidenció linajes diferentes en algunas especies totalizando un recuento de 44 especies, 13 más que las 31 originalmente detectadas. El método ABGD resultó en 40 especies en promedio para todas las particiones recursivas de los dos modelos de sustitución utilizados. Las especies que presentaron más de un linaje genético (especies putativas) con respecto a su determinación original fueron las siguientes: Akodon budini, Akodon simulator, Akodon spegazzinii, Andinomys edax, Necromys lactens, Oligoryzomys chacoensis, Oligoryzomys flavescens y Phyllotis tucumanus. Los resultados obtenidos sugieren una diversidad de roedores sigmodontinos más elevada que la actualmente reconocida en la región de estudio y destacan la necesidad de relevamientos faunísticos más exhaustivos que permitan un apropiado inventario de la biodiversidad.

Using DNA Barcoding for delimitation of species in sigmodontine rodents (Cricetidae) in north Argentina with special emphasis on those of the Yungas forest. We used DNA barcodes to explore the species diversity and the geographic variability of Sigmodontinae (Cricetidae) rodents in North Argentina. We analyzed 162 individuals from 50 localities belonging to 31 species primarily determined by morphology. Most of the studied localities (72%) are from the Yungas forest while 71% of the analyzed species inhabit some of their altitudinal strata. We performed two species delimitation analyses, the Bayesian Poisson Tree Processes (bPTP) method, and the Automated Barcode Gap Discovery (ABGD) method, the latter under two substitution models K2P and JC69. The bPTP method reported the presence of different lineages in some species totaling 44 species, 13 more than the 31 originally listed in our database. The ABGD method resulted in 40 species on average for all recursive partitions under the two substitution models. The following species presented more than one genetic lineage (putative species): Akodon budini, Akodon simulator, Akodon spegazzinii, Andinomys edax, Necromys lactens, Oligoryzomys chacoensis, Oligoryzomys flavescens and Phyllotis tucumanus. Our results suggest that the diversity of sigmodontine rodents in northwestern Argentina is higher than the currently recognized, and highlight the need for more exhaustive faunal surveys which allow a more accurate biodiversity inventory.

Sistemática de mamíferos de Argentina: patrones, tendencias y perspectivas en la acumulación de conocimientos

, , , , , , ,

La fauna de mamíferos de Argentina incluye 411 especies nativas vivientes y extintas en tiempos históricos (repartidas en 186 géneros, 47 familias y 12 órdenes), además de 21 especies introducidas y asilvestradas. En esta contribución se presenta un análisis de las tendencias históricas y recientes en el conocimiento sistemático de los mamíferos de Argentina y de algunos aspectos geográficos de este proceso. En líneas generales, las curvas de acumulación de nuevas especies son similares a las registradas para los mamíferos neotropicales en su conjunto. El trabajo taxonómico fue inicialmente realizado por investigadores del hemisferio norte, pero en la actualidad es principalmente realizado por científicos latinoamericanos. En los últimos 40 años se describieron 39 especies cuya distribución incluye a la Argentina, casi a razón de una por año. Treinta y una de estas especies nuevas son endémicas de Argentina y tienen distribuciones relativamente restringidas. Las ecorregiones donde se registraron más especies nuevas corresponden a las Yungas Australes, el Monte (Alto y Bajo) y el Chaco Seco, en el centro-oeste, centro y noroeste de Argentina; paradójicamente, algunas de estas ecorregiones se encuentran entre las menos exploradas de nuestro país. Finalmente, por su centralidad en el trabajo taxonómico, se discuten algunos aspectos relacionados con las colecciones de mamíferos en instituciones nacionales.

Systematics of mammals in Argentina: patterns, trends and perspectives in the accumulation of knowledge. The mammalian fauna of Argentina includes 411 living and recently extinct native species (divided into 186 genera, 47 families and 12 orders), as well as 21 introduced and feral species. This contribution presents an analysis of the historical and recent trends in the systematic knowledge of the mammals of Argentina and some geographical aspects of this process. Overall, the accumulation curves for new species are similar to those recorded for neotropical mammals as a whole. The taxonomic work was initially carried out by researchers from the northern hemisphere, but at present it is mainly carried out by Latin American scientists. In the last 40 years, 39 species were described whose distribution includes Argentina, almost at the rate of one per year. Thirty-one of these new species are endemic to Argentina and have relatively restricted distributions. The ecoregions where more new species are registered correspond to the Austral Yungas, the Monte (High and Low) and the Dry Chaco, in west-central, central and northwestern Argentina; paradoxically, some of these ecoregions are among the least explored in our country. Finally, due to its centrality in taxonomic work, some issues related to the national mammal collections are discussed.

On the distinction and availability of the new taxa proposed by Agnolin et al. 2019

, , , , , , , , , , , , , , ,

Recently, Agnolin et al. (2019) described 14 new species of mammals, including 12 rodents, one bat, and one carnivore, and one new subspecies of rodent. In addition, these authors proposed several other nomenclatorial acts: some nominal forms were removed from synonymies and hypothesized as distinct species, at the time that three new genera, one subtribe, and one tribe of mammals were also named. We reviewed the merits of all nomenclatorial acts proposed by Agnolin at al. (2019) and concluded that all 14 new species and the new subspecies, as well as those forms removed from synonymies, should be treated as synonyms of already known species. We suggest the same regarding the three new supraspecific taxa presented by Agnolin et al., two of which are not available as they fail to comply with the provisions of the International Code of Zoological Nomenclature. We end this contribution criticizing the way that mammal taxonomy was approached by Agnolin et al. (2019).

Sobre la distinción y disponibilidad de los nuevos taxones propuestos por Agnolin et al. 2019. Recientemente, Agnolin et al. (2019) describieron 14 especies nuevas de mamíferos, incluyendo 12 roedores, un murciélago y un carnívoro, y una nueva subespecie de roedor. Además, estos autores propusieron varios otros actos nomenclatoriales: algunas formas nominales se eliminaron de las sinonimias y se hipotetizaron como especies distintas; se nombraron tres nuevos géneros, una subtribu y una tribu de mamíferos. Revisamos todos los actos nomenclatoriales propuestos por Agnolin et al. (2019) y concluimos que las 14 nuevas especies y la nueva subespecie, así como las formas eliminadas de las sinonimias, deben tratarse como sinónimos de especies ya conocidas. Sugerimos lo mismo con respecto a los tres nuevos taxones supraespecíficos presentados por Agnolin et al. (2019), de los cuales dos no están disponibles ya que no cumplen con las disposiciones del Código Internacional de Nomenclatura Zoológica. Terminamos esta contribución criticando la forma en que Agnolin et al. (2019) realizaron su abordaje taxonómico.

Conservation perspectives for a highly disparate lineage of mammals: the Xenarthra

,

The Xenarthra, which are endemic to the Americas, consist of two distinct clades, the Pilosa (anteaters and sloths) and the Cingulata (armadillos). The association between xenarthrans and humans dates back to ancient times. Although these associations do not appear to have negatively impacted all wild populations, hunting probably contributed to the extinction of some xenarthrans in archaeological-geological times and, more recently, to the depletion or extinction of local populations. Undoubtedly, human activities are increasingly impacting the wild populations of many xenarthran species. According to the last assessment for the IUCN Red List of Threatened Species, 15 of the 30 species of Xenarthra are classified as Least Concern, five as Data Deficient, five as Near Threatened, and five are included in a threatened category, with one (Bradypus pygmaeus) being considered Critically Endangered, and four (Myrmecophaga tridactyla, Bradypus torquatus, Priodontes maximus, and Tolypeutes tricinctus) designated as Vulnerable. Here, we discuss the current taxonomic challenges of working with xenarthrans and the impacts of those challenges on the conservation of these animals. We evaluate the main threats affecting the Xenarthra now and in the future, we identify some successful conservation initiatives, and we highlight the importance of initiatives by individual experts. Our goals are to summarize the current status of xenarthrans and to facilitate the development and implementation of conservation strategies for these animals.

Estrategias de conservación para un linaje divergente de mamíferos: los Xenarthra. Los xenartros son un grupo de mamíferos endémicos de América que contiene dos clados distintos, Pilosa (hormigueros y perezosos) y Cingulata (armadillos). La asociación entre los xenartros y el hombre se remonta a tiempos remotos. Si bien algunas asociaciones pueden no haber representado un impacto negativo significativo en las poblaciones silvestres, la caza probablemente contribuyó a la extinción de xenartros en tiempos arqueológicos-geológicos y, más recientemente, a la degradación de sus poblaciones, llegando a registrarse numerosas extinciones locales. Sin lugar a duda, las actividades humanas están impactando cada vez más las poblaciones silvestres de los xenartros. Según la última evaluación global de los xenartros para la Lista Roja de Especies Amenazadas de la UICN, 15 de las 30 especies están clasificadas como Preocupación Menor (LC), cinco como Datos Insuficientes (DD), cinco como Casi Amenazadas (NT) y cinco están incluidas en una categoría amenazada, una de ellas en Peligro Crítico (CR; Bradypus pygmaeus) y cuatro Vulnerables (VU; Myrmecophaga tridactyla, Bradypus torquatus, Priodontes maximus y Tolypeutes tricinctus). En el presente trabajo discutimos los desafíos taxonómicos que estamos afrontando y su impacto en la conservación, evaluamos las principales amenazas que están sufriendo las especies y su perspectiva a futuro, enumeramos algunas iniciativas de conservación exitosas y destacamos la importancia de las iniciativas de expertos individuales. Con esta revisión pretendemos plantear las perspectivas relacionadas con la evaluación del estado de conservación de los xenartros, como así también con el desarrollo y la implementación de estrategias de conservación.

Perspectivas de conservação para uma linhagem altamente díspar de mamíferos: os Xenarthra. Os Xenarthra, endêmicos das Américas, consistem em dois clados distintos, Pilosa (tamanduás e preguiças) e Cingulata (tatus). A associação entre xenartros e humanos remonta aos tempos antigos. Embora essas associações não pareçam ter impactado negativamente todas as populações selvagens, a caça provavelmente contribuiu para a extinção de alguns xenartros nos tempos arqueológico-geológicos e, mais recentemente, para o esgotamento ou extinção das populações locais. Sem dúvida, as atividades humanas estão impactando cada vez mais as populações selvagens de muitas espécies de xenartros. De acordo com a última avaliação da Lista Vermelha de Espécies Ameaçadas da IUCN, 15 das 30 espécies de Xenarthra são classificadas como Menos Preocupantes (LC), 5 como Deficientes em Dados (DD), 5 como Quase Ameaçadas (NT) e 5 são incluídas em uma categoria ameaçada, com uma (Bradypus pygmaeus) sendo considerado Criticamente em Perigo (CR) e quatro (Myrmecophaga tridactyla, Bradypus torquatus, Priodontes maximus e Tolypeutes tricinctus) designados como Vulneráveis (VU). Aqui, discutimos os desafios taxonômicos atuais do trabalho com xenartros e os impactos desses desafios na conservação desses animais. Avaliamos as principais ameaças que afetam os Xenarthra agora e no futuro, identificamos algumas iniciativas de conservação bem-sucedidas e destacamos a importância das iniciativas de especialistas individuais. Nossos objetivos são resumir o status atual dos xenartros e facilitar o desenvolvimento e a implementação de estratégias de conservação para esses animais.

Incertidumbre taxonómica de un primate neotropical; el caso de Ateles fusciceps rufiventris Sclater, 1871 (Primates: Atelidae)

, ,

La taxonomía de los monos araña (Ateles spp.) en el Pacífico ha sido un tema de controversia en la literatura científica, con varias hipótesis derivadas de análisis biogeográficos, morfológicos y genéticos, tendiendo a volver difusa la certidumbre concerniente a la identidad específica de este taxón, lo cual complejiza la toma de decisiones para la conservación de este grupo de primates en el Neotrópico. Por lo tanto, en este estudio presentamos una revisión sistemática que soporta que las poblaciones de mono araña de la porción norandina del Pacífico deberían atribuirse a Ateles fusciceps rufiventris.

Taxonomic uncertainty in a Neotropical primate: the case of Ateles fusciceps rufiventris Sclater, 1871 (Primates: Atelidae). The taxonomy of spider monkeys (Ateles spp.) in the Colombian Pacific region has been controversial in the scientific literature, with several hypotheses derived from biogeographical, morphological and genetic analyses. Uncertainty concerning the specific identity of this taxon makes decision making more difficult for the conservation of this group of primates in the Neotropics. In this study, we present a systematic review which supports that populations of spider monkeys of the north-Andean portion of the Pacific should be assigned to Ateles fusciceps rufiventris.

Lista revisada de los mamíferos de Argentina

, , , , , ,

Se presenta una lista revisada de los mamíferos de Argentina, incorporando los cambios taxonómicos recientes y los nuevos registros para el país producidos desde la publicación de un listado previo en 2006. Se registraron 409 especies nativas, correspondientes a 181 géneros, 46 familias y 12 órdenes, más 23 especies introducidas con poblaciones silvestres.

Revised checklist of mammals from Argentina. We present a revised checklist of the mammals of Argentina, incorporating recent taxonomical changes and new records of mammals for the country produced since the publication of a previous list in 2006. We recorded 409 native species, corresponding to 181 genera, 46 families and 12 orders, plus 23 introduced taxa with wild populations.

Redescripción de Eremoryzomys polius (Rodentia: Cricetidae) y descripción de una nueva especie del género Eremoryzomys

,

Eremoryzomys polius (Osgood 1913) es un roedor orizomyino endémico de la cuenca alta del río Marañón, Perú, del que solo se conocen 15 ejemplares procedentes de 7 localidades y que no había sido registrado en los últimos 22 años. En este trabajo se reportan 4 localidades nuevas para E. polius, que expanden la distribución de este roedor. Adicionalmente, describimos una especie nueva para el género Eremoryzomys en base a la comparación de caracteres morfológicos cualitativos y cuantitativos con E. polius. La especie nueva de Eremoryzomys se diferencia de E. polius en los siguientes rasgos: cola corta ligeramente bicoloreada; almohadillas de las patas posteriores oscuras; almohadillas tenar e hipotenar casi contiguas; cráneo más pequeño, con un rostro corto y grácil; cresta nucal desarrollada; forámenes incisivos que llegan hasta el anterocono del M1, serie molar más corta y proceso coronoides triangular. La nueva especie es endémica de los bosques premontanos del Amazonas de la cuenca media del río Marañón, agregando evidencia de la importancia de esta región como centro de endemismo y de la necesidad de su conservación. Finalmente, sugerimos que E. polius, en su actual concepción, es aún un complejo de especies.

Redescription of Eremoryzomys polius (Rodentia: Cricetidae) and description of a new species of the genus Eremoryzomys. Eremoryzomys polius (Osgood 1913) is an oryzomyine rodent endemic to the upper basin of the Marañón River in Peru, known from only 15 specimens at 7 localities and with no new records in at least 22 years. Here we report an expansion of the geographic distribution of E. polius by confirming its presence at four new locations near the Marañón River. In addition, we describe a new species of Eremoryzomys based on comparison of its morphological and morphometric characteristics with E. polius. The new species of Eremoryzomys differs from E. polius in the following traits: slightly bicolored and short tail; dark hind leg pads; thenar and hypothenar pads nearly contiguous; small skull with a short and gracile rostrum; well-developed nuchal ridge; short incisive foramen reaching the anterocone of M1; shorter molar series and triangular coronoid process. This new species is endemic to premontane Amazon forest of the middle basin of the Marañon River, adding support for the importance of this region as a center of endemism and as a focus for habitat conservation. Finally, we suggest that E. polius, as currently understood, remains a species complex.

¿Cuántas especies del género Dasyprocta (Rodentia, Dasyproctidae) hay en la Argentina?

,

Para la Argentina han sido citadas, dependiendo de los autores, una o dos especies del género Dasyprocta. En esta nota se presenta un análisis morfológico, cualitativo y cuantitativo, de la situación de este taxón en el extremo austral de su distribución (Argentina, Bolivia y Paraguay). El análisis de componentes principales, un análisis discriminante «libre de tamaño» y diferencias de coloración externa y en la arquitectura craneana sugieren que los individuos de Paraguay y el nordeste de Argentina (coloración general amarillenta, sutura nasofrontal generalmente en forma de W) son representativos de una misma especie biológica, distinguible de las poblaciones del centro de Bolivia y el noroeste de Argentina (coloración general rojiza, sutura nasofrontal generalmente en forma de U). Dado el reducido número de ejemplares revisados, la resolución de la situación taxonómica de los individuos del noroeste de Argentina con respecto a los del centro y sur de Bolivia queda supeditada a los resultados de nuevos estudios.

How many species of the genus Dasyprocta (Rodentia, Dasyproctidae) are present in Argentina? Argentina is said to support one or two species of the genus Dasyprocta, depending on the authors. In this paper we present a qualitative and quantitative morphological analysis of the status of this taxon at the southern end of its range (Argentina, Bolivia and Paraguay). Principal component analysis, “size free” discriminant analysis, and differences in external coloration and in the cranial architecture suggest that individuals of Paraguay and northeastern Argentina (general coloration yellowish, nasofrontal suture usually W-shaped) represent one biological species, distinct from those of central Bolivia and northwestern Argentina (general coloration reddish, nasofrontal suture generally U-shaped). Given the limited number of individuals studied, resolution of the taxonomic status of populations in northwest Argentina with respect to those from central and southern Bolivia is subject to the results of further studies.

Variación morfológica cualitativa y cuantitativa en Abrothrix longipilis (Cricetidae, Sigmodontinae)

,

Se estudió la taxonomía alfa de Abrothrix longipilis (Waterhouse, 1837), uno de los abrotriquinos más ampliamente distribuidos y abundantes en las porciones australes de Argentina y Chile. Se realizó un análisis morfológico cualitativo (6 caracteres discretos) y cuantitativo (18 medidas cráneo-dentarias) de 477 especímenes adultos, agrupados primero según un criterio geográfico y luego según su pertenencia a los clados definidos por un estudio filogeográfico previo basado en 2 marcadores moleculares. Los análisis multivariados (análisis de componentes principales y análisis discriminantes «libres de tamaño») indican que A. longipilis es un complejo que incluye por lo menos 2 especies: A. longipilis stricto sensu, aquí restringida al centro de Chile, y A. hirta (Thomas, 1895), distribuida en el sur de Chile y sudoeste de Argentina. Las poblaciones de A. hirta mostraron una correspondencia moderada entre los patrones filogeográficos y de variación fenotípica. Preliminarmente, puede considerarse que el tamaño en A. hirta se vincula más estrechamente con las características del ambiente (con los individuos más grandes en áreas boscosas, de mayor productividad primaria y los más pequeños en ambientes áridos, de menor productividad) antes que con su pertenencia a los distintos clados. En este escenario, la divergencia morfológica podría estar mayormente determinada por la selección diferencial a lo largo de un gradiente ambiental extremo, aun en presencia de flujo génico (modelo de divergencia con flujo génico).

Qualitative and quantitative morphological variation in Abrothrix longipilis (Cricetidae, Sigmodontinae). We studied the alpha taxonomy of Abrothrix longipilis (Waterhouse, 1837), one of the most widely distributed and abundant Abrotrichini along the southern portion of Argentina and Chile. We conducted a qualitative (6 discrete characters) and quantitative (18 skull and dental measurements) morphological analysis of 477 adult specimens, grouped first by geographical criteria and later by membership to the clades defined in a previous phylogeographical study based on 2 molecular markers. Multivariate analyses (principal component analysis, discriminant analyses) suggested that in its current conception A. longipilis is a species-complex that includes at least two nominal taxa: A. longipilis stricto sensu, here restricted to Central Chile, and A. hirta (Thomas, 1895), distributed in southern Chile and southwestern Argentina. Populations of A. hirta showed a moderate correspondence between phylogeographic and phenotypic patterns. Tentatively, we considered that general size in A. hirta is mostly linked to environmental conditions (with larger individuals in forested areas, under high primary productivity conditions and the smaller ones in arid environments of low productivity) rather than to their inclusion in different clades. Under this scenario, morphological differentiation was probably driven by differential selection across a sharp ecological gradient, in spite of gene flow (divergence-with-gene-flow model).