Rickettsia spp. seroprevalence in wild mammals from Arauca, Orinoquia region of Colombia

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Rickettsia includes pathogenic bacteria that commonly use mammals as reservoirs and amplifying hosts. In Colombia, the knowledge about mammals as reservoirs of these bacteria is limited, even in areas considered endemic regions for spotted fever group (SFG) rickettsiae. To identify wild mammals acting as potential reservoirs of Rickettsia spp., we collected blood from 573 individuals captured in the Orinoquia of Colombia and processed it to obtain serum (n = 351) and DNA (n = 250). The serum was evaluated using indirect immunofluorescence assays (IFA) for the detection of IgG antibodies to four SFG rickettsiae antigens (Rickettsia rickettsii, R. parkeri, R. amblyommatis, R. rhipicephali), and R. bellii of the Ancestral group (AG). We amplified a fragment of the rickettsial citrate synthase gene (gltA) to detect Rickettsia from blood samples. The IFA showed seropositivity in 122 individuals of 20 mammalian species. IgG antibodies titers to Rickettsia spp., at a cutoff of ≥ 1:64, were 70.49% in bats (n = 86), 21.31% in rodents (n = 26), 7.38% in marsupials (n = 9), and 0.82% in carnivores (n = 1). The potential antigens involved in a homologous reaction (PAIHR) were R. bellii (18.85%), R. amblyommatis (9.01%), R. rhipicephali (4.91%), R. rickettsii (4.91%), and R. parkeri (4.09%), respectively. Bats were the most seropositive hosts, with antibodies to different Rickettsia antigens. We detected Rickettsia in 2.8% of the DNA samples (n = 5) from rodents, bats, and marsupials, but we could not confirm the molecular identity of Rickettsia. The presence of antibodies indicated a possible exposure of the evaluated mammals to SFG and AG rickettsiae and supported that the Orinoco Region must be considered endemic for SFG rickettsiae.


Seroprevalencia de Rickettsia spp. en mamíferos silvestres de Arauca, región de la Orinoquia de Colombia. Rickettsia incluye bacterias patógenas que comúnmente utilizan a los mamíferos como reservorios y hospedadores amplificadores. En Colombia, el conocimiento sobre mamíferos reservorios de estas bacterias es limitado, incluso en áreas consideradas endémicas para rickettsias del grupo de las fiebres manchadas (GFM). Para identificar aquellos mamíferos silvestres que actúan como reservorios potenciales de Rickettsia spp., recolectamos muestras de sangre de 573 individuos capturados en la Orinoquia de Colombia y las procesamos para obtener suero (n = 351) y ADN (n = 250). El suero se evaluó mediante ensayos de inmunofluorescencia indirecta (IFA) para la detección de anticuerpos IgG contra cuatro antígenos de rickettsias del GFM (Rickettsia rickettsii, R. parkeri, R. amblyommatis, R. rhipicephali) y R. bellii del grupo Ancestral (GA). Además, amplificamos un fragmento del gen rickettsial citrato sintasa (gltA) para detectar Rickettsia spp. a partir de muestras de sangre total. Los resultados de IFA mostraron seropositividad en 122 individuos de 20 especies de mamíferos. Los títulos de anticuerpos IgG contra Rickettsia spp., en un punto de corte de ≥ 1:64, fueron 70,49% en murciélagos (n = 86), 21,31% en roedores (n = 26), 7,38% en marsupiales (n = 9), y 0,82% en carnívoros (n = 1). Los posibles antígenos implicados en una reacción homóloga (PAIHR) fueron R. bellii (18,85%), R. amblyommatis (9,01%), R. rhipicephali (4,91%), R. rickettsii (4,91%) y R. parkeri (4,09%), respectivamente. Los murciélagos fueron los hospedadores más seropositivos, con presencia de anticuerpos contra diferentes antígenos de Rickettsia. Detectamos Rickettsia en el 2,8% de las muestras de ADN (n = 5) de roedores, murciélagos y marsupiales, pero no fue posible confirmar la identidad molecular de estas. La presencia de anticuerpos indica una posible exposición de los mamíferos evaluados a las rickettsias del GFM y GA, y dan un soporte a que la Orinoquia debe ser considerada endémica para rickettsias del GFM.

Graphical abstract for the article “Rickettsia spp. seroprevalence in wild mammals from Arauca, Orinoquia region of Colombia” (Velásquez-Guarín et al., 2024)

Reflexiones acerca del «reasilvestramiento» en la Argentina

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Forum

The genus Dasyprocta Illiger, 1811 (Mammalia: Rodentia) in Colombia

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Two species of Dasyprocta are currently recognized in Colombia. However, the taxonomic history of this genus is complex, with several available names for different populations. Here, we explore intra and interspecific variation of the two species currently recorded in Colombia, D. fuliginosa y D. punctata, and evaluate whether morphological characters allow the separation between specimens from different geographical regions. In addition, we clarify the application of subspecific names to different populations in the country and the distribution patterns of D. punctata subspecies. We show that D. fuliginosa and D. punctata are allopatric in Colombia. D. fuliginosa is distributed in the Amazon, Orinoco and part of the North Andean regions (eastern foothills of the Eastern Cordillera), whereas D. punctata is found in the Caribbean, Chocó and western foothills of North Andean regions of the country. Although there are no clear morphometric or morphological differences in the skull between most taxa, different coat colorations are associated with different geographical regions and contrasting ecosystems. D. punctata candelensis is distributed in the High Magdalena River Basin, North-Andean Province, instead of the Chocó Region as suggested by other authors. D. punctata chocoensis is found in the Colombian Pacific coast and western foothills of the Western Cordillera; D. punctata colombiana is found in the northern part of Colombia in the Caribbean Region. We also found specimens matching the description of D. punctata zuliae from the North-Andean Province in the Eastern Cordillera of Colombia. Despite the present geographic differences in coloration, further revisionary work—including genetic approaches—is needed to further understand the diversity of the genus in Colombia.


El género Dasyprocta Illiger, 1811 (Mammalia: Rodentia) en Colombia. Actualmente se reconocen dos especies del género Dasyprocta en Colombia. Sin embargo, la historia taxonómica del género es compleja, con varios nombres disponibles para diferentes poblaciones. En este trabajo exploramos la variación intra e interespecífica de las dos especies reconocidas en Colombia, D. fuliginosa y D. punctata, y evaluamos los caracteres morfológicos que permiten la separación entre ejemplares procedentes de diferentes regiones geográficas del país. Además, clarificamos la asignación de los nombres subespecíficos a diferentes poblaciones y los patrones de distribución de las subespecies de D. punctata. Dasyprocta fuliginosa y D. punctata son alopátricas en Colombia. Dasyprocta fuliginosa se distribuye en las regiones de la Amazonía, la Orinoquía y parte de la región Norandina (estribaciones orientales de la cordillera Oriental), mientras que D. punctata se encuentra en las regiones Caribe, Chocó y al occidente de la cordillera Oriental en la región Norandina. Aunque no hay variación morfométrica o morfológica craneal entre la mayoría de los taxones, diferentes coloraciones están asociadas con diferentes regiones geográficas y ecosistemas contrastantes. D. punctata candelensis se distribuye en la cuenca alta del río Magdalena, en la provincia Norandina, en lugar de la región del Chocó como ha sido sugerido por otros autores. D. punctata chocoensis se encuentra en la región Pacífica de Colombia y las estribaciones occidentales de la cordillera Occidental; D. punctata colombiana se encuentra en el norte de Colombia en la región Caribe. Además, encontramos ejemplares que se ajustan a la descripción de D. punctata zuliae de la Provincia Norandina en la cordillera Oriental de Colombia. A pesar de las diferencias geográficas de coloración, un trabajo de revisión adicional, que incluya aproximaciones genéticas, es necesario para entender mejor la diversidad de este género en Colombia.

Riqueza, endemismo y conservación de los mamíferos de Colombia

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Se actualiza la diversidad de especies de mamíferos de Colombia con base en una nueva revisión de especímenes en las mayores colecciones del país y el extranjero y la compilación de cambios taxonómicos recientes que involucran especies presentes en el país. El resultado de estos cambios es un total de 492 especies nativas, que representa un incremento neto de 62 especies respecto a la lista previamente existente (año 2000), lo cual es proporcionalmente mayor al resultado de actualizaciones en otros países neotropicales. Aunque el nivel de conocimiento difiere notoriamente entre grupos, proveemos algunos indicadores generales, como diversidad a nivel de los órdenes, endemismo, patrones de distribución y estado de conservación. La mayor riqueza de especies se da en los órdenes Chiroptera (198 spp.) y Rodentia (122 spp.), pero hay 23 especies endémicas de roedores, contra solo siete de murciélagos. Dependiendo de la naturaleza y escala de las evaluaciones, 39 (MAVDT) a 52 (UICN) especies de mamíferos colombianos se consideran en situación de peligro. Las mayores amenazas continúan siendo la deforestación, así como la cacería y el comercio ilegal.


Richness, endemism and conservation of Colombian mammals. We update the list of Colombian mammal species based upon a new revision of specimens in the major collections within and outside the country and a compilation of recent taxonomic changes of species present in the country. The result of these changes is a total of 492 native species, which represents a net increment of 62 species with respect to the previous list published in the year 2000, and this exceeds similar updates in other Neotropical countries. Although the level of knowledge differs greatly between groups, we provide some general indicators, as diversity on the level of orders, endemism, patterns of distribution, and conservation state. The greatest species richness occurs in the orders Chiroptera (198 spp.) and Rodentia (122 spp.), but there are 23 endemic species of rodents in contrast to only seven endemic bats. According to the nature and scale of the evaluations, between 39 (MAVDT) and 52 (IUCN) species of Colombian mammals are considered to be endangered. The major threats are still deforestation, hunting and illegal commerce.

Revisión cráneo-dentaria de Procyon (Carnivora: Procyonidae) en Colombia y Ecuador, con notas sobre su taxonomía y distribución

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En América del Sur, dos especies del género Procyon han sido históricamente registradas: P. cancrivorus y P. lotor; sin embargo, el conocimiento relacionado con la morfología, la historia natural y su distribución en Colombia y Ecuador es limitado, razón por la cual se ha cuestionado la presencia de P. lotor en esta parte del continente. Con el propósito de contribuir al conocimiento de Procyon en estos países, elaboramos una evaluación morfológica y morfométrica craneana; utilizamos 24 medidas que examinamos por medio de análisis multivariados y pruebas estadísticas estándar. Aclaramos dudas relacionadas con la presencia de P. lotor en Colombia y actualizamos la distribución de P. cancrivorus en ambos países. Nuestros resultados muestran que las dos especies se encuentran en Colombia y pueden diferenciarse por el ancho del P4 y por la relación longitud del paladar después del M2/longitud total del paladar. Caracteres morfológicos que diferencian las dos especies son: molariformes más masivos con cúspides anchas y redondeadas en P. cancrivorus, mientras que en P. lotor son más agudas. Procyon lotor se encuentra restringida al norte de Colombia, mientras que P. cancrivorus está más ampliamente distribuida en varias regiones naturales hasta los 2350 msnm en los Andes. Los ejemplares de P. cancrivorus del noroccidente de Colombia presentan características dentarias que concuerdan con las propuestas para la subespecie P. c. proteus y sugerimos que este nombre debería aplicarse a estas poblaciones; sin embargo, el estatus subespecífico de las poblaciones colombianas de P. lotor y de las poblaciones ecuatorianas de P. cancrivorus es incierto.


Cranio-dental revision of Procyon (Carnivora: Procyonidae) in Colombia and Ecuador, with remarks on its taxonomy and distribution. In South America, two species of Procyon have been historically recorded: P. cancrivorus and P. lotor. However, the knowledge related to the morphology, natural history and distribution in Colombia and Ecuador is limited; for this reason the presence of P. lotor in this part of the continent has been questioned. In order to contribute to the knowledge of Procyon in these countries, we developed a cranial morphological and morphometric evaluation; we used twenty-four measures that were analyzed using multivariate analysis and standard statistical. We elucidated doubts regarding P. lotor‘s presence in Colombia and updated the distribution of P. cancrivorus in both countries. Our results show that both species are present in Colombia and can be distinguished by the P4 width and the palate length after M2/palate total length ratio. Morphological characters that differentiated the two species are massive molar teeth with broad and round cusps in P. cancrivorus, whereas in P. lotor are sharper. Procyon lotor is restricted to northern Colombia, while P. cancrivorus is more widely distributed in different natural regions up to 2350 m in the Andes. Procyon cancrivorus specimens from northwestern Colombia have dental characteristics consistent with the proposals for the subspecies P. c. proteus and we suggest that this name should be applied to these populations. Nevertheless, the subspecific status of the colombian populations of P. lotor and ecuatorian populations of P. cancrivorus remain uncertain.

New records of Peropteryx leucoptera and first record of Peropteryx pallidoptera (Chiroptera–Emballonuridae) from Colombia

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We present new records of Peropteryx leucoptera from two localities in the Colombian Llanos. For this species these records constitute both the northernmost record and the first time it has been found in a different ecosystem such as the savannas of the Orinoco. In addition we report the first record of P. pallidoptera from the eastern Andean slopes in the Amazonian foothills of Colombia, which constitutes the northernmost known record for this species.


Nuevo registros de Peropteryx leucoptera y primer registro de Peropteryx pallidoptera (Chiroptera–Emballonuridae) para Colombia. Presentamos nuevos registros de Peropteryx leucoptera de dos localidades de los Llanos Orientales de Colombia. Para esta especie, estos reportes constituyen los registros más al norte y la primera vez que es encontrada en un ecosistema diferente como lo son las sabanas del Orinoco. Adicionalmente presentamos el primer registro de P. pallidoptera en la vertiente oriental de los Andes, piedemonte amazónico de Colombia, que constituye el registro más al norte que se conoce de esta especie.

Geographic range extensions and taxonomic notes on bats of the genus Lonchophylla (Phyllostomidae) from Colombia

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As a result of a systematic review of nectar feeding bats in the genus Lonchophylla (Phyllostomidae) deposited in the scientific collections of the Instituto de Ciencias Naturales (ICN) in Bogotá and the Museo de Historia Natural of the Universidad del Cauca (MHNUC) in Popayán, we report range extensions for three Colombian species. Lonchophylla cadenai is reported from Pueblo Rico, Risaralda, representing an increase in both altitudinal and latitudinal ranges; L. handleyi is reported from Cueva de los Guácharos, Huila, confirming the presence of this taxon in Colombia and representing its northernmost known record; and L. pattoni is reported from Leticia, Amazonas, which constitutes the third known collecting locality for this taxon and represents the northernmost known record for the species. In addition, an annotated list of all Lonchophylla specimens present in the two studied collections is included.


Extensiones en los rangos de distribución y notas taxonómicas sobre murciélagos del género Lonchophylla (Phyllostomidae) de Colombia. Como resultado de una revisión sistemática de murciélagos nectarívoros del género Lonchophylla (Phyllostomidae) depositados en las colecciones científicas del Instituto de Ciencias Naturales (ICN) en Bogotá y el Museo de Historia Natural de la Universidad del Cauca (MHNUC) en Popayán, reportamos extensiones en los rangos de distribución para tres especies. Lonchophylla cadenai es registrada de Pueblo Rico, Risaralda, y representa un incremento tanto en su rango altitudinal como latitudinal; L. handleyi es registrada para la Cueva de los Guácharos, Huila, lo cual confirma la presencia de este taxón en Colombia, siendo esta la localidad más al norte conocida para esta especie; y L. pattoni es registrada para Leticia, Amazonas, la cual constituye el tercer registro conocido para esta especie y el registro más norte de su distribución. Adicionalmente, se incluye una lista anotada de los ejemplares del género Lonchophylla revisados en estas dos colecciones.

Nuevo registro de la comadreja colombiana Mustela felipei (Carnivora: Mustelidae), con notas sobre su distribución y conservación

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Reportamos un nuevo ejemplar de M. felipei para Colombia, el cual constituye el sexto registro confirmado para esta especie. Se reconsidera la identificación de dos ejemplares previamente referidos como M. felipei procedentes de Mera y del Valle de Tumbaco en Ecuador. Incluimos algunas anotaciones taxonómicas para facilitar la caracterización de las dos especies de Mustela registradas para el territorio colombiano: M. frenata y M. felipei. Basados en los registros confirmados para M. felipei, proponemos un modelo de distribución potencial para esta especie en Colombia, construido con el algoritmo Maxent. El modelo de distribución de M. felipei y mapas digitales de las áreas protegidas en Colombia fueron combinados en ArcGIS 9.3, con el fin de identificar aquellas áreas de importancia para la conservación de este taxón en el país. Nuestros datos corroboran la afinidad de M. felipei por los ecosistemas de alta montaña y su aparente incapacidad ecológica para la colonización de tierras bajas. En nuestro modelo, áreas de alta disponibilidad de hábitat (> 60%) estuvieron asociadas con cinco áreas protegidas en Colombia reconocidas por el Sistema de Parques Naturales Nacionales (PNN). Sugerimos el establecimiento de planes de censo y monitoreo de M. felipei en las cinco áreas de protección identificadas, con especial énfasis en el PNN Puracé, cuya área se halla completamente inmersa en el área de disponibilidad de M. felipei en nuestro modelo.


New record of the Colombian weasel Mustela felipei (Carnivora: Mustelidae), with notes on its distribution and conservation. We report a new specimen of M. felipei for Colombia, which constitutes the sixth confirmed record for the species. We reconsidered the identification of two Ecuadorian specimens from Mera and Valle de Tumbaco previously reported as M. felipei. We include some taxonomic notes to differentiate between the two species of Mustela recorded in Colombia M. felipei y M. frenata. Based on confirmed records of M. felipei we suggest a model of potential distribution of the species created with the Maxent algorithm. Information on M. felipei potential distribution and geographic data on protected areas in Colombia was combined in ArcGIS 9.3 to identify areas of conservation for this taxon in the country. Our data support the affinity between M. felipei distribution and highland ecosystems, and its apparent ecological incapability for colonizing the lowlands. In our model, areas of high habitat suitability (> 60%) were associated with five protected areas in Colombia recognized by the Sistema de Parques Naturales Nacionales (PNN). We propose the establishment of systematic censuses and monitoring plans across identified protected areas for M. felipei, with special attention to PNN Puracé which area is completely contained within the area of high suitability for M. felipei in our model.