Habitat suitability and conservation priorities for the lowland tapir (Tapirus terrestris) in the Colombian Orinoquia

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The lowland tapir (Tapirus terrestris) is distributed throughout much of South America and is considered a keystone species because it fulfills crucial ecological roles in tropical forests. Tapirs are associated with forest ecosystems and water bodies throughout their geographic range. In the Orinoquia region of Colombia, tapirs are found in natural savannahs and in dense, gallery, and riparian forests. Although there is data available on tapir natural history, basic knowledge is still lacking across much of its distribution. This research generated a baseline of tapir distribution to assess habitat use and conservation areas across the Orinoquia. We built a database of 110 individual occurrences from camera trap sampling conducted in the departments of Arauca, Casanare, Vichada, and Meta. We built candidate models using the Wallace 2.1.3 R package and selected the best-performing models, which we then implemented in Maxent 3.4.4 to obtain the final distribution outputs. Precipitation seasonality and land cover were the most important variables for tapir distribution, and areas of dense gallery and riparian forests in good conservation state were found to be highly suitable habitats, especially in Arauca and Vichada. Tapir populations likely became locally extinct in the southern part of the department of Casanare. Our results constitute the first approximation of the distribution of the lowland tapir for the Orinoquia region of Colombia. It is necessary to generate additional regional and local data to allow for a more precise evaluation of distribution in these heterogeneous landscapes. The findings of this study provide useful information for conservation strategies and highlight the need for further research to better understand the distribution and habitat use of the lowland tapir in this region.


Idoneidad de hábitat y prioridades de conservación para la danta de tierras bajas (Tapirus terrestris) en la Orinoquia colombiana. El tapir de tierras bajas se distribuye en el Sur de América y se considera una especie clave en los ecosistemas, ya que cumple diferentes papeles ecológicos. Los tapires están asociados con ecosistemas boscosos y cuerpos de agua a lo largo de su rango geográfico. En la Orinoquia colombiana, los tapires se encuentran en las sabanas naturales y en los bosques de galería, riparios y densos. A pesar de que existe información sobre su historia natural, todavía hay vacíos de información sobre la especie en gran parte de su rango geográfico. Esta investigación genera información base sobre la distribución del tapir y una aproximación al uso de hábitat y áreas de conservación a lo largo de la Orinoquia. Para ello, se construyó una base de datos de 110 ocurrencias provenientes de muestreos por medio de cámaras trampa que se llevaron a cabo entre 2016 y 2022 en diferentes áreas de los departamentos de Arauca, Casanare, Vichada y Meta. Se utilizaron variables ambientales relacionadas con cobertura de la tierra, topografía, y variables bioclimáticas. La precipitación temporal y los bosques presentaron la mayor contribución en la determinación de la distribución de las dantas, y las áreas con bosques de galería, riparios y densos en buen estado de conservación se constituyen como hábitats de alta idoneidad, especialmente en Arauca y Vichada. Se estima que las poblaciones de danta en el departamento de Casanare se extinguieron localmente. Los resultados obtenidos se constituyen como la primera aproximación de la distribución de la danta en la Orinoquia colombiana. Los resultados proveen información relevante para la generación de estrategias de conservación y resaltan la necesidad de futuras investigaciones para el entendimiento de la distribución y uso de hábitat de los tapires en la región.

Arbustización y mamíferos en predios ganaderos del espinal entrerriano: ¿una conciliación difícil de lograr?

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El Espinal es una de las ecorregiones más transformadas de Argentina. Pese a las presiones de cambio en el uso del suelo hacia actividades agrícolas intensivas, algunos productores integran la ganadería con el bosque nativo, generando una oportunidad para conciliar conservación con producción. Actualmente, la degradación de estos bosques suele definirse según las condiciones del forraje, sin considerar criterios ambientales más amplios. En este estudio comparamos la riqueza, tasa de encuentro (como proxy de intensidad de uso) y composición de especies del ensamble de mamíferos medianos y grandes, estimadas a partir de datos generados con cámaras trampa, entre sitios con < 15 % de cobertura arbustiva («no degradado», en términos productivos, n = 18) y > 25 % («degradado», en términos productivos, n = 18) en predios ganaderos del Espinal entrerriano. Asimismo, analizamos la relación entre la riqueza y la tasa de encuentro de mamíferos con la estructura vegetal, la proporción y cantidad de coberturas del suelo circundantes, la accesibilidad (como proxy de presión de caza), y la tasa de encuentro de ganado (como proxy de intensidad de uso del ganado). En total, registramos 10 especies nativas y dos introducidas. La riqueza total de especies de mamíferos fue similar entre sitios arbustizados y no arbustizados, pero los primeros albergaron más especies en promedio (2,8 ± 0,3 versus 1,6 ± 0,3). Además de la cobertura arbustiva, la tasa de encuentro del ganado y el número de coberturas de suelo circundantes también influyeron significativamente en la tasa de encuentro de mamíferos en cada sitio, y la distancia a localidades, en la tasa de encuentro de mamíferos con interés cinegético. Si bien los sitios arbustizados son menos favorables para la ganadería, contribuirían a mantener la biodiversidad nativa del Espinal entrerriano, y a propiciar la compatibilidad entre conservación y producción.


Shrub encroachment and mammals in livestock farms of Entre Ríos’ Espinal: a difficult balance to achieve? The Espinal is one of Argentina’s most transformed ecoregions. Despite pressure to change land use towards intensive agricultural activities, some ranchers integrate livestock with the native forest, representing an opportunity to reconcile conservation with production. Currently, the degradation of these forests is usually defined by forage conditions without considering broader environmental criteria. In this study, we use camera traps to compare species richness, encounter rates (as a proxy of use intensity), and composition of the small- and medium-sized mammal assemblage between sites with < 15 % shrub cover (“not degraded”, in ranching-productive terms, n = 18) and > 25 % (“degraded”, in ranching-productive terms, n = 18) in properties with cattle ranching in the Espinal of Entre Ríos province. Additionally, we analyzed the relationship between mammal species richness and encounter rates with the vegetation structure, the proportion and quantity of surrounding land covers, accessibility (as a proxy for hunting pressure), and livestock encounter rate (as a proxy of livestock use intensity). In total, we registered 10 native and two introduced species. The total richness of mammal species was similar between shrubby and not-shrubby sites, but the shrubby sites hosted more species on average (2.8 ± 0.3 versus 1.6 ± 0.3). Besides the shrub coverage, the livestock encounter rate, and the number of surrounding land covers, also significantly influenced the richness and encounter rate of mammals in each site. Although shrubby sites are less favorable for ranching, they would contribute to maintaining the native biodiversity of the Espinal in Entre Ríos and to fostering compatibility between conservation and production.

¡Solo me importa el suelo! Análisis de la distribución y uso del hábitat del piche llorón (Chaetophractus vellerosus) en la subpoblación En Peligro del este de la provincia de Buenos Aires, Argentina

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La subpoblación del piche llorón (Chaetophractus vellerosus) del este de la provincia de Buenos Aires está categorizada como En Peligro, y su principal amenaza es la minería calcárea. Los objetivos de este estudio fueron actualizar el área de distribución de esta subpoblación, evaluar los efectos ambientales y del uso del suelo sobre su presencia, y determinar el hábitat perdido y/o subóptimo para la especie. Se realizaron 56 transectos al azar de 1000 × 12 m (37 en suelo calcáreo-arenoso y 19 en suelo húmico) en busca de evidencias indirectas de C. vellerosus (cuevas y hozaduras). Además del tipo de suelo, se registraron la cobertura y altura vegetal, la distancia al centro urbano más cercano, el grado de explotación minera, la carga ganadera y la cantidad de perros. Para evaluar el efecto del tipo de suelo, se compararon 19 transectos calcáreo-arenosos con 19 húmicos. Para las demás características, se analizaron solo transectos calcáreo-arenosos, mediante el uso de modelos lineales generalizados mixtos. Solo 25 transectos fueron positivos, todos en suelo calcáreo-arenoso, y se hallaron 2594 evidencias. Ningún modelo de los estudiados explicó asociación entre las demás características y la presencia de la especie. En base a los resultados obtenidos, se delimitó un área potencial de distribución menor de 118 km2. De acuerdo con las amenazas más importantes (minería, Ruta Provincial Nº 11 y urbanización), se estimó que el 26% de su hábitat se perdió o es subóptimo. Por lo tanto, la conservación de los suelos arenosos es clave para la supervivencia de la subpoblación En Peligro del piche llorón.


I only care about the soil! Analysis of the distribution and habitat use of the screaming hairy armadillo (Chaetophractus vellerosus) in the Endangered subpopulation of eastern Buenos Aires province, Argentina. The subpopulation of the screaming hairy armadillo (Chaetophractus vellerosus) in the east of the province of Buenos Aires is categorized as Endangered, with calcareous mining being its main threat. The aims of this study were to update the distribution area of this subpopulation, evaluate the effects of environmental factors and land use on its presence, and determine the lost and/or suboptimal habitat for the species. To look for indirect evidence of C. vellerosus (burrows and food probes), 56 random transects of 1000 m × 12 m were carried out (37 in calcareous-sandy soil and 19 in humic soil). In addition to soil type, vegetation height and cover, distance to the nearest urban center, degree of mining exploitation, cattle load, and number of dogs were recorded. To evaluate the effect of soil type, 19 calcareous-sandy transects were paired with 19 humic transects. For the other characteristics, only calcareous-sandy transects were analyzed using generalized linear mixed models. Only 25 transects were positive, all in calcareous-sandy soils, finding 2594 evidences. No model explained the association between the other characteristics and the presence of the species. Based on these results, a potential distribution area of less than 118 km2 was delimited. According to the most important threats (mining, Provincial Route #11 and urbanization), it was estimated that 26% of its habitat was lost or is suboptimal. Therefore, the conservation of sandy soils is key for the survival of the Endangered screaming hairy armadillo subpopulation.

Graphical abstract for the article “¡Solo me importa el suelo! Análisis de la distribución y uso del hábitat del piche llorón (Chaetophractus vellerosus) en la subpoblación En Peligro del este de la provincia de Buenos Aires, Argentina” (Pagnutti et al., 2025)

Sarna sarcóptica en vicuñas (Vicugna vicugna Molina, 1782) del oeste de Bolivia: análisis de gravedad de la enfermedad con indicadores ecológicos y epidemiológicos

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En Bolivia, la vicuña (Vicugna vicugna Molina, 1782) es objeto de manejo para el aprovechamiento de su fibra, a través de la captura y esquila de animales vivos en la naturaleza. La sarna sarcóptica representa una amenaza para los camélidos sudamericanos silvestres. Durante octubre y noviembre de 2018 se capturaron 92 vicuñas nortinas (V. v. mensalis), y se obtuvieron biometrías y raspados de lesiones de sarna de tres edades y seis sitios de captura en el área protegida Apolobamba, al oeste de Bolivia. Se obtuvo el índice de condición corporal (ICC), con LogNat de peso * LogNat de longitud interna del miembro posterior derecho. Se obtuvieron los indicadores epidemiológicos prevalencia ( %) y porcentaje ( %) de extensión de lesiones corporales por sarna. Para evaluar la edad y el sitio de captura en el que la sarna es más grave, se emplearon modelos lineales generalizados con significancia en el modelo completo, de ICC, presencia de sarna, extensión de lesiones corporales por sarna sarcóptica, y sus combinaciones. El ICC empleado en esta especie es una aproximación no destructiva al estado nutricional y de salud de la población de vicuñas evaluadas. La edad es un factor de riesgo relevante, ya que los individuos menores de un año presentaron lesiones cutáneas de sarna sarcóptica más extensas, en comparación con las edades más avanzadas; y las vicuñas de sitios de captura con menor condición corporal también tendían a presentar lesiones cutáneas de sarna sarcóptica más extensas. La combinación de indicadores ecológicos y epidemiológicos permite evaluar la calidad del hábitat y la salud poblacional, y puede integrarse en el monitoreo de vicuñas en vida libre.


Sarcoptic mange in vicuñas (Vicugna vicugna Molina, 1782) from western Bolivia: severity analysis of the disease using ecological and epidemiological indicators. In Bolivia, the vicuña (Vicugna vicugna Molina, 1782) is managed for the harvest of its fiber, involving the capture and shearing of live animals in the wild. Sarcoptic mange may represent an emerging threat to wild South American camelids. During October and November 2018, 92 northern vicuñas (V. v. mensalis) were captured, and biometric data and skin scrapings from mange lesions were collected from three age groups across six capture sites in Apolobamba protected area, western Bolivia. The Body Condition Index (BCI) was calculated using the LogNat of weight * LogNat of the internal length of the right hind limb. Epidemiological indicators such as prevalence ( %) and percentage ( %) of body lesion extent due to mange were obtained. To evaluate the age and capture site where mange severity is highest, generalized linear models were employed, with significance in the full model, BCI, the presence of mange, the extent of body lesions caused by sarcoptic mange, and their combinations. The BCI used for this species provides a non-destructive approximation of the nutritional and health status of the evaluated vicuña population. Age was identified as a significant risk factor, with individuals under one year of age exhibiting more extensive sarcoptic mange lesions than older age groups. Vicuñas from capture sites with lower body condition tended to develop sarcoptic mange and exhibited more extensive skin lesions. The combination of ecological and epidemiological indicators enables the assessment of habitat quality and population health and can be integrated into the monitoring of wild vicuña populations.

Graphical abstract for the article “Sarna sarcóptica en vicuñas (Vicugna vicugna Molina, 1782) del oeste de Bolivia: análisis de severidad de la enfermedad con indicadores ecológicos y epidemiológicos” (Beltrán-Saavedra et al., 2005)

Abundance and habitat preferences of house mouse Mus musculus in the desert of northern Peru

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The house mouse is a commensal species that invades natural ecosystems and threatens both native rodents and ecosystems. Therefore, it is important to describe the population of Mus musculus in native ecosystems to develop effective management plans for eradicating or controlling this species. In this study, we assessed the abundance and habitat preferences of M. musculus in Reserva Nacional de Illescas (RNI) and Manglares de San Pedro de Vice (MSPV) using capture-recapture methods during 2021 and 2022. We recorded only a few captures (N = 3) of M. musculus in the RNI, whereas numerous captures and recaptures (N = 195 and N = 41, respectively) were recorded at the MSPV. Our analysis suggests that M. musculus prefers complex habitats. We discuss the implications of the presence of house mice in mangrove ecosystems and emphasize the population dynamics of this species for its control and management in legally protected areas. In conclusion, the population size of the house mouse varies among different habitats, with a preference for complex environments.


Abundancia y preferencias de hábitat del ratón doméstico Mus musculus en el desierto del norte del Perú. El ratón doméstico es una especie comensal que invade ecosistemas naturales y amenaza tanto a las especies nativas de roedores como a los ecosistemas. Por lo tanto, es importante describir la población de Mus musculus en ecosistemas nativos para diseñar planes de manejo efectivos con el objetivo de erradicar o controlar esta especie. En este estudio, evaluamos la abundancia y las preferencias de hábitat de M. musculus en la Reserva Nacional de Illescas (RNI) y en los Manglares de San Pedro de Vice (MSPV), usando métodos de captura-recaptura durante 2021 y 2022. Registramos algunas capturas de M. musculus en la RNI y numerosas capturas y recapturas de esta especie en los MSPV, y estimamos que M. musculus prefiere hábitats más complejos. Discutimos las consecuencias de la presencia del ratón doméstico en los manglares y resaltamos los aspectos poblacionales de esta especie para su control y manejo en áreas de conservación. Concluimos que el ratón doméstico varía el tamaño población entre los diferentes hábitats y muestra preferencia por hábitats complejos.

Graphical abstract for the article “Abundance and habitat preferences of house mouse (Mus musculus) in the desert of northern Peru” (Carrasco-Escudero et al., 2024)

Carnivorans from Uruguay: updated distribution and changes through time

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Carnivorans are vital for ecosystem functioning and are one of the main groups used for conservation purposes. However, some species receive less attention than others. As many ecological aspects of South American carnivorans are unknown, the distribution range becomes of primary importance for conservation use. We aimed to analyze the distribution of terrestrial carnivorans in Uruguay, yielding an updated database and including a temporal dimension of distribution changes. We searched the main collections of mammals and bibliographic references for carnivorans in Uruguay. We divided the records according to temporal provenance and analyzed the changes in knowledge of distributions according to time. We also analyzed species and family richness for actual times with a 25 × 25 km grid. Finally, we studied the possible bias in data gathering related to roads. We ensembled the most complete database for carnivoran distribution in Uruguay, with 1905 records. The country had a total species richness of 16, varying with time according to local extinctions and new records of different species. The most common species was Cerdocyon thous, while the least recorded was Nasua nasua. The jaguar Panthera onca has been extinct since historical times, while Pteronura brasiliensis has probably been extinct since actual times. The areas with higher species richness were located in the northeastern, south, and southeastern parts of the country. A bias in data gathering was present, marked by the proximity to roads. Finally, protected areas in Uruguay showed a different proportion of protected species, regardless of their surface.


Carnívoros de Uruguay: distribución actualizada y cambios a través del tiempo. Los carnívoros son vitales para el funcionamiento de los ecosistemas, y son uno de los grupos más usados para los objetivos de conservación. Sin embargo, muchas especies reciben más atención que otras. Como existen diversos aspectos ecológicos de carnívoros sudamericanos que se desconocen, los rangos de distribución son esenciales para las categorizaciones de conservación. Analizamos la distribución de los carnívoros terrestres en Uruguay para generar la base de datos más actualizada a la fecha, y estudiar los cambios temporales. Se relevaron especímenes de colecciones biológicas y referencias bibliográficas. Se dividieron los registros acorde a su proveniencia temporal y se analizaron los cambios en su distribución. Además, se analizó la riqueza de especies y familias, con una grilla de 25 × 25 km. Finalmente, se estudió el posible sesgo en la colecta de datos acorde a la cercanía de rutas. Se generó la base de datos más completa a la fecha, con 1905 registros. Uruguay tuvo una riqueza específica de 16, que ha variado, según el tiempo,con extinciones y nuevos registros. La especie más registrada fue Cerdoyon thous, mientras que la menos registrada fue Nasua nasua. El jaguar Panthera onca se encuentra extinto desde tiempos históricos, mientras que Pteronura brasiliensis se encuentra posiblemente extinta desde tiempos actuales. Las áreas con mayor riqueza se encontraron en las partes noreste, sur y sureste del país. Se encontró un sesgo en los datos, marcado por la cercanía a las rutas. Finalmente, las áreas protegidas mostraron una diferente proporción de especies protegidas, independientemente de su superficie.

Graphical abstract for the article “Carnivorans from Uruguay: updated distribution and changes through time” (Schiaffini et al., 2023)

Efecto de la fragmentación sobre la diversidad de murciélagos (Chiroptera) y estréblidos (Diptera: Streblidae) y redes de interacción en Puebla, México

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En el presente estudio se comparó la riqueza, diversidad y especialización de las redes de interacción hospedador-ectoparásito en dos ambientes contrastantes de Puebla, México. Se colocaron redes de niebla para la captura de murciélagos, y los ectoparásitos fueron colectados manualmente con pinzas entomológicas. Se registraron 188 murciélagos de 20 especies, de las cuales se colectaron 263 estréblidos de 11 especies. La riqueza y abundancia de murciélagos y estréblidos fue mayor en el bosque continuo, aunque el análisis de diversidad verdadera mostró que no existían diferencias significativas entre el sitio fragmentado y el bosque continuo. En el caso de los estréblidos, aunque la diversidad fue significativamente mayor en el bosque continuo, los valores de la carga parasitaria fueron similares en ambos sitios. Las redes de interacciones de los dos sitios fueron altamente especializadas y presentaron valores similares; no obstante, se observó un mayor número de enlaces en el bosque continuo. Estos resultados sugieren que la fragmentación aparentemente puede influir más sobre la diversidad de estréblidos que en la de sus hospedadores; esto puede deberse a que en ambos sitios los murciélagos Phyllostomidae tuvieron una mayor presencia. En los estréblidos, aunque no hay un efecto sobre la especialización producto de la especificidad de las interacciones murciélago-estréblido, sí existe una disminución en la riqueza de especies que da como resultado una disminución en el número de interacciones.


The effect of fragmentation on the diversity of bats (Chiroptera) and bat’s flies (Diptera: Streblidae) and interaction networks in Puebla, Mexico. The present study compares the richness, diversity, and specialization of host-ectoparasite interaction networks in two contrasting environments in Puebla, Mexico. Mist nets were placed to capture bats, while ectoparasites were collected manually with entomological tweezers. A total of 188 bats of 20 species were recorded, of which 263 bat Streblidae bat flies of 11 species were collected. The richness and abundance of bats and bat flies were higher in continuous forest, even though the analysis of true bat diversity showed no significant difference between the fragmented site and the continuous forest. Moreover, while there was a significant difference between sites for bat flies, there was no significant difference between sites for their parasitic loads. The interaction networks of both sites were highly specialized with similar values. However, a higher number of links were observed at the continuous forest. These results suggest that fragmentation may have a greater influence on the diversity of Streblidae flies than on the diversity of their hosts. This result may be due to the fact that Phyllostomidae bats were more common at both sites. Although there is no effect on the specialization of the bat flies due to the specificity of the bat-Streblidae interactions formed over evolutionary time, there is a decrease in species richness and, as a result, a decrease in the number of interactions.

Graphical abstract for the article “Efecto de la fragmentación sobre la diversidad de murciélagos (Chiroptera) y estréblidos (Diptera: Streblidae) y redes de interacción en Puebla, México” (Tlapaya-Romero et al., 2024)

Potential contributions of mammals to human well-being in Argentina

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Mammals are key components of biodiversity, mediating ecosystem functions, mainly because of the diversity of forms and functions of this group. Understanding and making explicit the role of mammals underpinning Nature’s Contributions to People (NCP) or directly contributing to human well-being would help to influence policy formulation towards sustainable development and nature conservation. Through a workshop held at the XXXII Jornadas Argentinas de Mastozoología and subsequent collaborative work, we compiled information related to Mammals’ Contributions to People in Argentina (MCP-Arg) based on participants’ interpretation of the available literature and their field experience. Argentinian mammals contribute to 12 of the 18 defined NCPs. We derived numerous MCP-Arg from studies that focused mainly on ecological processes and conservation, revealing an information gap in MCP-Arg description, quantification, and mapping. All taxa contribute similarly to the overall contributions, highlighting the importance of preserving mammal diversity. Conservation should also be framed at the local community rather than regional scales, aiming to preserve ecological functioning and contributions to human well-being, especially within regulation contributions. Our results show destructive feedback between threats and habitat-related contributions, with habitat degradation being the greatest threat to mammalian contributions, and habitat maintenance the most threatened one. Our research indicates that a substantial amount of knowledge about MCP-Arg is available through narratives and interpretations. Considering the NCP approach to mammalian research, we can make significant contributions to both mammal conservation and human well-being.


Contribuciones potenciales al bienestar humano de los mamíferos en Argentina. Debido a su diversidad de formas y funciones, los mamíferos son componentes clave de la biodiversidad y cumplen importantes funciones ecosistémicas. Para formular políticas que permitan un desarrollo sostenible y la conservación de la naturaleza, es fundamental comprender y explicitar el papel de los mamíferos en sustentar las Contribuciones de la Naturaleza a las Personas (CNP). Durante un taller realizado en las XXXII Jornadas Argentinas de Mastozoología y un posterior estudio colaborativo, hemos recopilado información relacionada con las CNP de mamíferos en Argentina (CMP-Arg) en base a la interpretación de la literatura disponible y la experiencia de campo. En la Argentina, los mamíferos contribuyen en 12 de las 18 CNP definidas. Deducimos numerosas CMP-Arg de estudios centrados principalmente en procesos ecológicos y de conservación, que muestran un vacío de información en cuanto a descripción, cuantificación y mapeo de CMP-Arg. Todos los taxones realizan aportes similares a las contribuciones totales, lo que destaca la importancia de preservar la diversidad de mamíferos. Los esfuerzos de conservación deben enmarcarse no solo a escala regional, sino también a escala local, con el objetivo de preservar las CNP. Nuestros resultados han mostrado una asociación entre amenazas y contribuciones relacionadas con el hábitat: la degradación de este ha sido la principal amenaza para las contribuciones, y su mantenimiento la contribución más amenazada. Nuestra investigación muestra que una cantidad importante de conocimiento sobre CMP-Arg está disponible a través de narrativas y representaciones sociales. Mediante la implementación del enfoque del CNP en la investigación mastozoológica, podemos hacer aportes significativos tanto para la conservación de los mamíferos como para el bienestar humano.

Graphical abstract for the article “Potential contributions of mammals to human well-being in Argentina” (Alonso Roldán et al., 2022)